Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXM7

PINK1, Serine/threonine-protein kinase PINK1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 581 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PINK1Q9BXM7 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PINK1Q9BXM7 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PINK1Q9BXM7 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PINK1Q9BXM7 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PINK1Q9BXM7 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PINK1Q9BXM7 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PINK1Q9BXM7 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PINK1Q9BXM7 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PINK1Q9BXM7 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PINK1Q9BXM7 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PINK1Q9BXM7 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
PINK1Q9BXM7 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PINK1Q9BXM7 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PINK1Q9BXM7 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PINK1Q9BXM7 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PINK1Q9BXM7 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PINK1Q9BXM7 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PINK1Q9BXM7 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PINK1Q9BXM7 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PINK1Q9BXM7 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PINK1Q9BXM7 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PINK1Q9BXM7 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PINK1Q9BXM7 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PINK1Q9BXM7 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PINK1Q9BXM7 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PINK1Q9BXM7 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PINK1Q9BXM7 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PINK1Q9BXM7 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PINK1Q9BXM7 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PINK1Q9BXM7 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PINK1Q9BXM7 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PINK1Q9BXM7 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PINK1Q9BXM7 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PINK1Q9BXM7 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PINK1Q9BXM7 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PINK1Q9BXM7 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
PINK1Q9BXM7 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PINK1Q9BXM7 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PINK1Q9BXM7 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC25■■□□□ 1.59
PINK1Q9BXM7 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PINK1Q9BXM7 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PINK1Q9BXM7 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PINK1Q9BXM7 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PINK1Q9BXM7 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PINK1Q9BXM7 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PINK1Q9BXM7 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PINK1Q9BXM7 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PINK1Q9BXM7 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PINK1Q9BXM7 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PINK1Q9BXM7 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PINK1Q9BXM7 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PINK1Q9BXM7 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PINK1Q9BXM7 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PINK1Q9BXM7 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PINK1Q9BXM7 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PINK1Q9BXM7 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PINK1Q9BXM7 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PINK1Q9BXM7 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PINK1Q9BXM7 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PINK1Q9BXM7 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PINK1Q9BXM7 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PINK1Q9BXM7 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
PINK1Q9BXM7 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PINK1Q9BXM7 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
PINK1Q9BXM7 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PINK1Q9BXM7 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PINK1Q9BXM7 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PINK1Q9BXM7 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PINK1Q9BXM7 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PINK1Q9BXM7 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PINK1Q9BXM7 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PINK1Q9BXM7 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PINK1Q9BXM7 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PINK1Q9BXM7 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PINK1Q9BXM7 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PINK1Q9BXM7 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PINK1Q9BXM7 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PINK1Q9BXM7 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PINK1Q9BXM7 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PINK1Q9BXM7 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PINK1Q9BXM7 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PINK1Q9BXM7 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
PINK1Q9BXM7 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PINK1Q9BXM7 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PINK1Q9BXM7 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PINK1Q9BXM7 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PINK1Q9BXM7 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PINK1Q9BXM7 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PINK1Q9BXM7 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PINK1Q9BXM7 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PINK1Q9BXM7 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
PINK1Q9BXM7 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PINK1Q9BXM7 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PINK1Q9BXM7 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PINK1Q9BXM7 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PINK1Q9BXM7 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PINK1Q9BXM7 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PINK1Q9BXM7 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PINK1Q9BXM7 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PINK1Q9BXM7 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms