Protein–RNA interactions for Protein: Q9BV35

SLC25A23, Calcium-binding mitochondrial carrier protein SCaMC-3, humanhuman

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC25A23Q9BV35 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SLC25A23Q9BV35 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SLC25A23Q9BV35 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SLC25A23Q9BV35 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SLC25A23Q9BV35 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
SLC25A23Q9BV35 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SLC25A23Q9BV35 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SLC25A23Q9BV35 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SLC25A23Q9BV35 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
SLC25A23Q9BV35 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
SLC25A23Q9BV35 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SLC25A23Q9BV35 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SLC25A23Q9BV35 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SLC25A23Q9BV35 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
SLC25A23Q9BV35 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SLC25A23Q9BV35 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SLC25A23Q9BV35 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SLC25A23Q9BV35 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
SLC25A23Q9BV35 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SLC25A23Q9BV35 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SLC25A23Q9BV35 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SLC25A23Q9BV35 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SLC25A23Q9BV35 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
SLC25A23Q9BV35 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SLC25A23Q9BV35 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SLC25A23Q9BV35 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SLC25A23Q9BV35 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SLC25A23Q9BV35 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SLC25A23Q9BV35 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SLC25A23Q9BV35 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SLC25A23Q9BV35 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SLC25A23Q9BV35 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SLC25A23Q9BV35 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SLC25A23Q9BV35 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
SLC25A23Q9BV35 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SLC25A23Q9BV35 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SLC25A23Q9BV35 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SLC25A23Q9BV35 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SLC25A23Q9BV35 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SLC25A23Q9BV35 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SLC25A23Q9BV35 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SLC25A23Q9BV35 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SLC25A23Q9BV35 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SLC25A23Q9BV35 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SLC25A23Q9BV35 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SLC25A23Q9BV35 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SLC25A23Q9BV35 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SLC25A23Q9BV35 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SLC25A23Q9BV35 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SLC25A23Q9BV35 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SLC25A23Q9BV35 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SLC25A23Q9BV35 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SLC25A23Q9BV35 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SLC25A23Q9BV35 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
SLC25A23Q9BV35 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SLC25A23Q9BV35 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SLC25A23Q9BV35 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SLC25A23Q9BV35 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SLC25A23Q9BV35 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SLC25A23Q9BV35 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SLC25A23Q9BV35 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
SLC25A23Q9BV35 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SLC25A23Q9BV35 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SLC25A23Q9BV35 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SLC25A23Q9BV35 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SLC25A23Q9BV35 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SLC25A23Q9BV35 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SLC25A23Q9BV35 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SLC25A23Q9BV35 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SLC25A23Q9BV35 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SLC25A23Q9BV35 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SLC25A23Q9BV35 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SLC25A23Q9BV35 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SLC25A23Q9BV35 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SLC25A23Q9BV35 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SLC25A23Q9BV35 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SLC25A23Q9BV35 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SLC25A23Q9BV35 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SLC25A23Q9BV35 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SLC25A23Q9BV35 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SLC25A23Q9BV35 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SLC25A23Q9BV35 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SLC25A23Q9BV35 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SLC25A23Q9BV35 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SLC25A23Q9BV35 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SLC25A23Q9BV35 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SLC25A23Q9BV35 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
SLC25A23Q9BV35 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SLC25A23Q9BV35 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SLC25A23Q9BV35 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SLC25A23Q9BV35 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SLC25A23Q9BV35 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SLC25A23Q9BV35 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SLC25A23Q9BV35 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SLC25A23Q9BV35 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SLC25A23Q9BV35 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SLC25A23Q9BV35 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SLC25A23Q9BV35 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SLC25A23Q9BV35 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SLC25A23Q9BV35 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.2 ms