Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUV0

RSRP1, Arginine/serine-rich protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSRP1Q9BUV0 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RSRP1Q9BUV0 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RSRP1Q9BUV0 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RSRP1Q9BUV0 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RSRP1Q9BUV0 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RSRP1Q9BUV0 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RSRP1Q9BUV0 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RSRP1Q9BUV0 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RSRP1Q9BUV0 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RSRP1Q9BUV0 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RSRP1Q9BUV0 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RSRP1Q9BUV0 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RSRP1Q9BUV0 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RSRP1Q9BUV0 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RSRP1Q9BUV0 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RSRP1Q9BUV0 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RSRP1Q9BUV0 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RSRP1Q9BUV0 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RSRP1Q9BUV0 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RSRP1Q9BUV0 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RSRP1Q9BUV0 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RSRP1Q9BUV0 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RSRP1Q9BUV0 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RSRP1Q9BUV0 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RSRP1Q9BUV0 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RSRP1Q9BUV0 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RSRP1Q9BUV0 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RSRP1Q9BUV0 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RSRP1Q9BUV0 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RSRP1Q9BUV0 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RSRP1Q9BUV0 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RSRP1Q9BUV0 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RSRP1Q9BUV0 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RSRP1Q9BUV0 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RSRP1Q9BUV0 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RSRP1Q9BUV0 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RSRP1Q9BUV0 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RSRP1Q9BUV0 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RSRP1Q9BUV0 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RSRP1Q9BUV0 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RSRP1Q9BUV0 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RSRP1Q9BUV0 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RSRP1Q9BUV0 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RSRP1Q9BUV0 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RSRP1Q9BUV0 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RSRP1Q9BUV0 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RSRP1Q9BUV0 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RSRP1Q9BUV0 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RSRP1Q9BUV0 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RSRP1Q9BUV0 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RSRP1Q9BUV0 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RSRP1Q9BUV0 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RSRP1Q9BUV0 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RSRP1Q9BUV0 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RSRP1Q9BUV0 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RSRP1Q9BUV0 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RSRP1Q9BUV0 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
RSRP1Q9BUV0 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RSRP1Q9BUV0 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RSRP1Q9BUV0 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RSRP1Q9BUV0 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RSRP1Q9BUV0 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RSRP1Q9BUV0 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RSRP1Q9BUV0 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RSRP1Q9BUV0 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RSRP1Q9BUV0 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RSRP1Q9BUV0 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RSRP1Q9BUV0 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RSRP1Q9BUV0 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RSRP1Q9BUV0 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RSRP1Q9BUV0 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RSRP1Q9BUV0 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RSRP1Q9BUV0 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RSRP1Q9BUV0 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RSRP1Q9BUV0 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RSRP1Q9BUV0 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RSRP1Q9BUV0 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RSRP1Q9BUV0 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RSRP1Q9BUV0 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
RSRP1Q9BUV0 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RSRP1Q9BUV0 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RSRP1Q9BUV0 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RSRP1Q9BUV0 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RSRP1Q9BUV0 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RSRP1Q9BUV0 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RSRP1Q9BUV0 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RSRP1Q9BUV0 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RSRP1Q9BUV0 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RSRP1Q9BUV0 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RSRP1Q9BUV0 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RSRP1Q9BUV0 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RSRP1Q9BUV0 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RSRP1Q9BUV0 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RSRP1Q9BUV0 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RSRP1Q9BUV0 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RSRP1Q9BUV0 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
RSRP1Q9BUV0 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RSRP1Q9BUV0 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RSRP1Q9BUV0 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RSRP1Q9BUV0 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms