Protein–RNA interactions for Protein: Q99613

EIF3C, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit C, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 913 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF3CQ99613 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
EIF3CQ99613 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
EIF3CQ99613 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
EIF3CQ99613 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
EIF3CQ99613 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
EIF3CQ99613 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
EIF3CQ99613 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
EIF3CQ99613 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
EIF3CQ99613 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
EIF3CQ99613 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
EIF3CQ99613 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
EIF3CQ99613 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
EIF3CQ99613 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
EIF3CQ99613 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
EIF3CQ99613 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
EIF3CQ99613 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
EIF3CQ99613 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
EIF3CQ99613 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC29.22■■■□□ 2.27
EIF3CQ99613 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
EIF3CQ99613 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
EIF3CQ99613 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
EIF3CQ99613 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
EIF3CQ99613 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
EIF3CQ99613 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
EIF3CQ99613 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
EIF3CQ99613 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
EIF3CQ99613 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
EIF3CQ99613 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
EIF3CQ99613 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
EIF3CQ99613 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
EIF3CQ99613 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC29.17■■■□□ 2.26
EIF3CQ99613 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
EIF3CQ99613 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
EIF3CQ99613 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
EIF3CQ99613 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
EIF3CQ99613 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
EIF3CQ99613 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
EIF3CQ99613 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
EIF3CQ99613 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
EIF3CQ99613 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
EIF3CQ99613 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
EIF3CQ99613 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
EIF3CQ99613 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
EIF3CQ99613 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
EIF3CQ99613 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
EIF3CQ99613 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
EIF3CQ99613 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
EIF3CQ99613 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
EIF3CQ99613 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
EIF3CQ99613 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
EIF3CQ99613 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
EIF3CQ99613 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
EIF3CQ99613 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
EIF3CQ99613 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
EIF3CQ99613 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
EIF3CQ99613 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
EIF3CQ99613 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
EIF3CQ99613 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC29■■■□□ 2.23
EIF3CQ99613 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
EIF3CQ99613 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
EIF3CQ99613 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
EIF3CQ99613 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
EIF3CQ99613 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
EIF3CQ99613 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
EIF3CQ99613 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
EIF3CQ99613 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
EIF3CQ99613 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
EIF3CQ99613 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
EIF3CQ99613 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.23
EIF3CQ99613 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
EIF3CQ99613 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
EIF3CQ99613 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
EIF3CQ99613 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
EIF3CQ99613 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
EIF3CQ99613 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
EIF3CQ99613 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
EIF3CQ99613 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
EIF3CQ99613 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC28.9■■■□□ 2.22
EIF3CQ99613 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
EIF3CQ99613 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
EIF3CQ99613 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
EIF3CQ99613 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
EIF3CQ99613 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
EIF3CQ99613 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
EIF3CQ99613 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
EIF3CQ99613 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
EIF3CQ99613 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
EIF3CQ99613 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
EIF3CQ99613 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
EIF3CQ99613 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
EIF3CQ99613 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
EIF3CQ99613 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
EIF3CQ99613 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
EIF3CQ99613 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
EIF3CQ99613 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
EIF3CQ99613 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
EIF3CQ99613 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
EIF3CQ99613 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
EIF3CQ99613 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
EIF3CQ99613 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms