Protein–RNA interactions for Protein: Q96RJ3

TNFRSF13C, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 13C, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF13CQ96RJ3 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TNFRSF13CQ96RJ3 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TNFRSF13CQ96RJ3 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TNFRSF13CQ96RJ3 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TNFRSF13CQ96RJ3 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TNFRSF13CQ96RJ3 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TNFRSF13CQ96RJ3 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TNFRSF13CQ96RJ3 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
TNFRSF13CQ96RJ3 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TNFRSF13CQ96RJ3 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TNFRSF13CQ96RJ3 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TNFRSF13CQ96RJ3 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TNFRSF13CQ96RJ3 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TNFRSF13CQ96RJ3 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TNFRSF13CQ96RJ3 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TNFRSF13CQ96RJ3 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TNFRSF13CQ96RJ3 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TNFRSF13CQ96RJ3 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TNFRSF13CQ96RJ3 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TNFRSF13CQ96RJ3 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TNFRSF13CQ96RJ3 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TNFRSF13CQ96RJ3 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TNFRSF13CQ96RJ3 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TNFRSF13CQ96RJ3 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TNFRSF13CQ96RJ3 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TNFRSF13CQ96RJ3 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TNFRSF13CQ96RJ3 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TNFRSF13CQ96RJ3 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TNFRSF13CQ96RJ3 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TNFRSF13CQ96RJ3 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TNFRSF13CQ96RJ3 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TNFRSF13CQ96RJ3 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TNFRSF13CQ96RJ3 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TNFRSF13CQ96RJ3 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TNFRSF13CQ96RJ3 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TNFRSF13CQ96RJ3 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
TNFRSF13CQ96RJ3 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TNFRSF13CQ96RJ3 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TNFRSF13CQ96RJ3 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TNFRSF13CQ96RJ3 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TNFRSF13CQ96RJ3 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TNFRSF13CQ96RJ3 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TNFRSF13CQ96RJ3 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TNFRSF13CQ96RJ3 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TNFRSF13CQ96RJ3 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TNFRSF13CQ96RJ3 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TNFRSF13CQ96RJ3 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TNFRSF13CQ96RJ3 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TNFRSF13CQ96RJ3 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TNFRSF13CQ96RJ3 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TNFRSF13CQ96RJ3 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TNFRSF13CQ96RJ3 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TNFRSF13CQ96RJ3 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TNFRSF13CQ96RJ3 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TNFRSF13CQ96RJ3 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TNFRSF13CQ96RJ3 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TNFRSF13CQ96RJ3 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TNFRSF13CQ96RJ3 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TNFRSF13CQ96RJ3 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TNFRSF13CQ96RJ3 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TNFRSF13CQ96RJ3 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TNFRSF13CQ96RJ3 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TNFRSF13CQ96RJ3 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TNFRSF13CQ96RJ3 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TNFRSF13CQ96RJ3 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TNFRSF13CQ96RJ3 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TNFRSF13CQ96RJ3 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TNFRSF13CQ96RJ3 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
TNFRSF13CQ96RJ3 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TNFRSF13CQ96RJ3 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TNFRSF13CQ96RJ3 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TNFRSF13CQ96RJ3 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TNFRSF13CQ96RJ3 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TNFRSF13CQ96RJ3 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TNFRSF13CQ96RJ3 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TNFRSF13CQ96RJ3 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TNFRSF13CQ96RJ3 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TNFRSF13CQ96RJ3 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TNFRSF13CQ96RJ3 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TNFRSF13CQ96RJ3 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TNFRSF13CQ96RJ3 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TNFRSF13CQ96RJ3 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TNFRSF13CQ96RJ3 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TNFRSF13CQ96RJ3 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TNFRSF13CQ96RJ3 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TNFRSF13CQ96RJ3 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TNFRSF13CQ96RJ3 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TNFRSF13CQ96RJ3 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TNFRSF13CQ96RJ3 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
TNFRSF13CQ96RJ3 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TNFRSF13CQ96RJ3 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
TNFRSF13CQ96RJ3 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TNFRSF13CQ96RJ3 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TNFRSF13CQ96RJ3 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TNFRSF13CQ96RJ3 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TNFRSF13CQ96RJ3 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TNFRSF13CQ96RJ3 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TNFRSF13CQ96RJ3 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TNFRSF13CQ96RJ3 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TNFRSF13CQ96RJ3 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 144.3 ms