Protein–RNA interactions for Protein: Q96PL1

SCGB3A2, Secretoglobin family 3A member 2, humanhuman

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCGB3A2Q96PL1 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SCGB3A2Q96PL1 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SCGB3A2Q96PL1 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SCGB3A2Q96PL1 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SCGB3A2Q96PL1 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SCGB3A2Q96PL1 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SCGB3A2Q96PL1 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
SCGB3A2Q96PL1 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SCGB3A2Q96PL1 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SCGB3A2Q96PL1 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SCGB3A2Q96PL1 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SCGB3A2Q96PL1 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SCGB3A2Q96PL1 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SCGB3A2Q96PL1 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SCGB3A2Q96PL1 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SCGB3A2Q96PL1 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SCGB3A2Q96PL1 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SCGB3A2Q96PL1 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SCGB3A2Q96PL1 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SCGB3A2Q96PL1 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SCGB3A2Q96PL1 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
SCGB3A2Q96PL1 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SCGB3A2Q96PL1 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SCGB3A2Q96PL1 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SCGB3A2Q96PL1 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SCGB3A2Q96PL1 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SCGB3A2Q96PL1 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SCGB3A2Q96PL1 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SCGB3A2Q96PL1 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SCGB3A2Q96PL1 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SCGB3A2Q96PL1 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SCGB3A2Q96PL1 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
SCGB3A2Q96PL1 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SCGB3A2Q96PL1 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SCGB3A2Q96PL1 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SCGB3A2Q96PL1 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SCGB3A2Q96PL1 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SCGB3A2Q96PL1 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SCGB3A2Q96PL1 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SCGB3A2Q96PL1 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SCGB3A2Q96PL1 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SCGB3A2Q96PL1 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SCGB3A2Q96PL1 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SCGB3A2Q96PL1 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SCGB3A2Q96PL1 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SCGB3A2Q96PL1 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SCGB3A2Q96PL1 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SCGB3A2Q96PL1 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SCGB3A2Q96PL1 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SCGB3A2Q96PL1 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SCGB3A2Q96PL1 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SCGB3A2Q96PL1 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SCGB3A2Q96PL1 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SCGB3A2Q96PL1 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SCGB3A2Q96PL1 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SCGB3A2Q96PL1 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SCGB3A2Q96PL1 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SCGB3A2Q96PL1 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SCGB3A2Q96PL1 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SCGB3A2Q96PL1 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SCGB3A2Q96PL1 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
SCGB3A2Q96PL1 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SCGB3A2Q96PL1 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SCGB3A2Q96PL1 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SCGB3A2Q96PL1 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SCGB3A2Q96PL1 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SCGB3A2Q96PL1 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SCGB3A2Q96PL1 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SCGB3A2Q96PL1 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SCGB3A2Q96PL1 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SCGB3A2Q96PL1 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SCGB3A2Q96PL1 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SCGB3A2Q96PL1 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SCGB3A2Q96PL1 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SCGB3A2Q96PL1 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SCGB3A2Q96PL1 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SCGB3A2Q96PL1 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SCGB3A2Q96PL1 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SCGB3A2Q96PL1 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SCGB3A2Q96PL1 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SCGB3A2Q96PL1 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SCGB3A2Q96PL1 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SCGB3A2Q96PL1 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SCGB3A2Q96PL1 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SCGB3A2Q96PL1 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SCGB3A2Q96PL1 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SCGB3A2Q96PL1 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SCGB3A2Q96PL1 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SCGB3A2Q96PL1 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SCGB3A2Q96PL1 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SCGB3A2Q96PL1 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SCGB3A2Q96PL1 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SCGB3A2Q96PL1 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SCGB3A2Q96PL1 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SCGB3A2Q96PL1 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SCGB3A2Q96PL1 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SCGB3A2Q96PL1 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SCGB3A2Q96PL1 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SCGB3A2Q96PL1 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SCGB3A2Q96PL1 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84 ms