Protein–RNA interactions for Protein: Q96BT7

ALKBH8, Alkylated DNA repair protein alkB homolog 8, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 664 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALKBH8Q96BT7 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
ALKBH8Q96BT7 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
ALKBH8Q96BT7 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
ALKBH8Q96BT7 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
ALKBH8Q96BT7 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
ALKBH8Q96BT7 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
ALKBH8Q96BT7 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
ALKBH8Q96BT7 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
ALKBH8Q96BT7 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
ALKBH8Q96BT7 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
ALKBH8Q96BT7 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
ALKBH8Q96BT7 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
ALKBH8Q96BT7 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
ALKBH8Q96BT7 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
ALKBH8Q96BT7 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
ALKBH8Q96BT7 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
ALKBH8Q96BT7 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
ALKBH8Q96BT7 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
ALKBH8Q96BT7 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
ALKBH8Q96BT7 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
ALKBH8Q96BT7 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
ALKBH8Q96BT7 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
ALKBH8Q96BT7 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
ALKBH8Q96BT7 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
ALKBH8Q96BT7 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
ALKBH8Q96BT7 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC27.24■■□□□ 1.95
ALKBH8Q96BT7 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
ALKBH8Q96BT7 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
ALKBH8Q96BT7 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
ALKBH8Q96BT7 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
ALKBH8Q96BT7 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
ALKBH8Q96BT7 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
ALKBH8Q96BT7 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
ALKBH8Q96BT7 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
ALKBH8Q96BT7 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
ALKBH8Q96BT7 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
ALKBH8Q96BT7 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ALKBH8Q96BT7 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ALKBH8Q96BT7 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
ALKBH8Q96BT7 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
ALKBH8Q96BT7 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
ALKBH8Q96BT7 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
ALKBH8Q96BT7 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
ALKBH8Q96BT7 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
ALKBH8Q96BT7 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
ALKBH8Q96BT7 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
ALKBH8Q96BT7 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
ALKBH8Q96BT7 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
ALKBH8Q96BT7 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
ALKBH8Q96BT7 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
ALKBH8Q96BT7 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
ALKBH8Q96BT7 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
ALKBH8Q96BT7 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
ALKBH8Q96BT7 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
ALKBH8Q96BT7 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
ALKBH8Q96BT7 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC27.07■■□□□ 1.92
ALKBH8Q96BT7 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
ALKBH8Q96BT7 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ALKBH8Q96BT7 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ALKBH8Q96BT7 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ALKBH8Q96BT7 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ALKBH8Q96BT7 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
ALKBH8Q96BT7 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
ALKBH8Q96BT7 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
ALKBH8Q96BT7 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
ALKBH8Q96BT7 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ALKBH8Q96BT7 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ALKBH8Q96BT7 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ALKBH8Q96BT7 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
ALKBH8Q96BT7 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
ALKBH8Q96BT7 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
ALKBH8Q96BT7 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
ALKBH8Q96BT7 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
ALKBH8Q96BT7 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
ALKBH8Q96BT7 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
ALKBH8Q96BT7 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
ALKBH8Q96BT7 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
ALKBH8Q96BT7 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ALKBH8Q96BT7 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ALKBH8Q96BT7 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
ALKBH8Q96BT7 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
ALKBH8Q96BT7 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
ALKBH8Q96BT7 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
ALKBH8Q96BT7 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
ALKBH8Q96BT7 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
ALKBH8Q96BT7 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
ALKBH8Q96BT7 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
ALKBH8Q96BT7 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
ALKBH8Q96BT7 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
ALKBH8Q96BT7 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
ALKBH8Q96BT7 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
ALKBH8Q96BT7 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
ALKBH8Q96BT7 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
ALKBH8Q96BT7 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
ALKBH8Q96BT7 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
ALKBH8Q96BT7 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
ALKBH8Q96BT7 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
ALKBH8Q96BT7 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
ALKBH8Q96BT7 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
ALKBH8Q96BT7 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms