Protein–RNA interactions for Protein: Q8WVJ2

NUDCD2, NudC domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 157 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUDCD2Q8WVJ2 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NUDCD2Q8WVJ2 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NUDCD2Q8WVJ2 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NUDCD2Q8WVJ2 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NUDCD2Q8WVJ2 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NUDCD2Q8WVJ2 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NUDCD2Q8WVJ2 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NUDCD2Q8WVJ2 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NUDCD2Q8WVJ2 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NUDCD2Q8WVJ2 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NUDCD2Q8WVJ2 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NUDCD2Q8WVJ2 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NUDCD2Q8WVJ2 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NUDCD2Q8WVJ2 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NUDCD2Q8WVJ2 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NUDCD2Q8WVJ2 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NUDCD2Q8WVJ2 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NUDCD2Q8WVJ2 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NUDCD2Q8WVJ2 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NUDCD2Q8WVJ2 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NUDCD2Q8WVJ2 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NUDCD2Q8WVJ2 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NUDCD2Q8WVJ2 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NUDCD2Q8WVJ2 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NUDCD2Q8WVJ2 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NUDCD2Q8WVJ2 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NUDCD2Q8WVJ2 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NUDCD2Q8WVJ2 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NUDCD2Q8WVJ2 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NUDCD2Q8WVJ2 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NUDCD2Q8WVJ2 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NUDCD2Q8WVJ2 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NUDCD2Q8WVJ2 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NUDCD2Q8WVJ2 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NUDCD2Q8WVJ2 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NUDCD2Q8WVJ2 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NUDCD2Q8WVJ2 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NUDCD2Q8WVJ2 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NUDCD2Q8WVJ2 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NUDCD2Q8WVJ2 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NUDCD2Q8WVJ2 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NUDCD2Q8WVJ2 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NUDCD2Q8WVJ2 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NUDCD2Q8WVJ2 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NUDCD2Q8WVJ2 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NUDCD2Q8WVJ2 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NUDCD2Q8WVJ2 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NUDCD2Q8WVJ2 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
NUDCD2Q8WVJ2 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NUDCD2Q8WVJ2 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NUDCD2Q8WVJ2 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NUDCD2Q8WVJ2 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
NUDCD2Q8WVJ2 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
NUDCD2Q8WVJ2 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NUDCD2Q8WVJ2 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NUDCD2Q8WVJ2 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NUDCD2Q8WVJ2 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NUDCD2Q8WVJ2 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NUDCD2Q8WVJ2 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NUDCD2Q8WVJ2 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NUDCD2Q8WVJ2 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NUDCD2Q8WVJ2 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NUDCD2Q8WVJ2 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NUDCD2Q8WVJ2 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NUDCD2Q8WVJ2 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NUDCD2Q8WVJ2 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
NUDCD2Q8WVJ2 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NUDCD2Q8WVJ2 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NUDCD2Q8WVJ2 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NUDCD2Q8WVJ2 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NUDCD2Q8WVJ2 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NUDCD2Q8WVJ2 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NUDCD2Q8WVJ2 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NUDCD2Q8WVJ2 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NUDCD2Q8WVJ2 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NUDCD2Q8WVJ2 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NUDCD2Q8WVJ2 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NUDCD2Q8WVJ2 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NUDCD2Q8WVJ2 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NUDCD2Q8WVJ2 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NUDCD2Q8WVJ2 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NUDCD2Q8WVJ2 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NUDCD2Q8WVJ2 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NUDCD2Q8WVJ2 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NUDCD2Q8WVJ2 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NUDCD2Q8WVJ2 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NUDCD2Q8WVJ2 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NUDCD2Q8WVJ2 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NUDCD2Q8WVJ2 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NUDCD2Q8WVJ2 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NUDCD2Q8WVJ2 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NUDCD2Q8WVJ2 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NUDCD2Q8WVJ2 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NUDCD2Q8WVJ2 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NUDCD2Q8WVJ2 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NUDCD2Q8WVJ2 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NUDCD2Q8WVJ2 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NUDCD2Q8WVJ2 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NUDCD2Q8WVJ2 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NUDCD2Q8WVJ2 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms