Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHH9

ATL2, Atlastin-2, humanhuman

Predictions only

Length 583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATL2Q8NHH9 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
ATL2Q8NHH9 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
ATL2Q8NHH9 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
ATL2Q8NHH9 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
ATL2Q8NHH9 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
ATL2Q8NHH9 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
ATL2Q8NHH9 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
ATL2Q8NHH9 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
ATL2Q8NHH9 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
ATL2Q8NHH9 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
ATL2Q8NHH9 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
ATL2Q8NHH9 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
ATL2Q8NHH9 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
ATL2Q8NHH9 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
ATL2Q8NHH9 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
ATL2Q8NHH9 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
ATL2Q8NHH9 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
ATL2Q8NHH9 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
ATL2Q8NHH9 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
ATL2Q8NHH9 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
ATL2Q8NHH9 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
ATL2Q8NHH9 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
ATL2Q8NHH9 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
ATL2Q8NHH9 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
ATL2Q8NHH9 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
ATL2Q8NHH9 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
ATL2Q8NHH9 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
ATL2Q8NHH9 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
ATL2Q8NHH9 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
ATL2Q8NHH9 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC28.05■■■□□ 2.08
ATL2Q8NHH9 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
ATL2Q8NHH9 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ATL2Q8NHH9 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ATL2Q8NHH9 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
ATL2Q8NHH9 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
ATL2Q8NHH9 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
ATL2Q8NHH9 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
ATL2Q8NHH9 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
ATL2Q8NHH9 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
ATL2Q8NHH9 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
ATL2Q8NHH9 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
ATL2Q8NHH9 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC28■■■□□ 2.07
ATL2Q8NHH9 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
ATL2Q8NHH9 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
ATL2Q8NHH9 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
ATL2Q8NHH9 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC27.99■■■□□ 2.07
ATL2Q8NHH9 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
ATL2Q8NHH9 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
ATL2Q8NHH9 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
ATL2Q8NHH9 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
ATL2Q8NHH9 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
ATL2Q8NHH9 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
ATL2Q8NHH9 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
ATL2Q8NHH9 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
ATL2Q8NHH9 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
ATL2Q8NHH9 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
ATL2Q8NHH9 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
ATL2Q8NHH9 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC27.93■■■□□ 2.06
ATL2Q8NHH9 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
ATL2Q8NHH9 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
ATL2Q8NHH9 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
ATL2Q8NHH9 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
ATL2Q8NHH9 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
ATL2Q8NHH9 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
ATL2Q8NHH9 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
ATL2Q8NHH9 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
ATL2Q8NHH9 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
ATL2Q8NHH9 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
ATL2Q8NHH9 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
ATL2Q8NHH9 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
ATL2Q8NHH9 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
ATL2Q8NHH9 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
ATL2Q8NHH9 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
ATL2Q8NHH9 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
ATL2Q8NHH9 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
ATL2Q8NHH9 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
ATL2Q8NHH9 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
ATL2Q8NHH9 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
ATL2Q8NHH9 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
ATL2Q8NHH9 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
ATL2Q8NHH9 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
ATL2Q8NHH9 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
ATL2Q8NHH9 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
ATL2Q8NHH9 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
ATL2Q8NHH9 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
ATL2Q8NHH9 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
ATL2Q8NHH9 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
ATL2Q8NHH9 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
ATL2Q8NHH9 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
ATL2Q8NHH9 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
ATL2Q8NHH9 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
ATL2Q8NHH9 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
ATL2Q8NHH9 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
ATL2Q8NHH9 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
ATL2Q8NHH9 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
ATL2Q8NHH9 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
ATL2Q8NHH9 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
ATL2Q8NHH9 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
ATL2Q8NHH9 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
ATL2Q8NHH9 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.8 ms