Protein–RNA interactions for Protein: Q8NER5

ACVR1C, Activin receptor type-1C, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACVR1CQ8NER5 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
ACVR1CQ8NER5 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
ACVR1CQ8NER5 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
ACVR1CQ8NER5 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
ACVR1CQ8NER5 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
ACVR1CQ8NER5 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
ACVR1CQ8NER5 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
ACVR1CQ8NER5 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ACVR1CQ8NER5 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
ACVR1CQ8NER5 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
ACVR1CQ8NER5 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
ACVR1CQ8NER5 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
ACVR1CQ8NER5 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
ACVR1CQ8NER5 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
ACVR1CQ8NER5 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
ACVR1CQ8NER5 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
ACVR1CQ8NER5 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
ACVR1CQ8NER5 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
ACVR1CQ8NER5 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
ACVR1CQ8NER5 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
ACVR1CQ8NER5 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
ACVR1CQ8NER5 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
ACVR1CQ8NER5 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
ACVR1CQ8NER5 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
ACVR1CQ8NER5 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC27.09■■□□□ 1.93
ACVR1CQ8NER5 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC27.09■■□□□ 1.93
ACVR1CQ8NER5 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ACVR1CQ8NER5 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ACVR1CQ8NER5 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ACVR1CQ8NER5 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ACVR1CQ8NER5 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
ACVR1CQ8NER5 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ACVR1CQ8NER5 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ACVR1CQ8NER5 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ACVR1CQ8NER5 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
ACVR1CQ8NER5 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
ACVR1CQ8NER5 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
ACVR1CQ8NER5 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC27■■□□□ 1.91
ACVR1CQ8NER5 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
ACVR1CQ8NER5 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
ACVR1CQ8NER5 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ACVR1CQ8NER5 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
ACVR1CQ8NER5 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
ACVR1CQ8NER5 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
ACVR1CQ8NER5 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
ACVR1CQ8NER5 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
ACVR1CQ8NER5 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
ACVR1CQ8NER5 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
ACVR1CQ8NER5 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
ACVR1CQ8NER5 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
ACVR1CQ8NER5 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
ACVR1CQ8NER5 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
ACVR1CQ8NER5 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ACVR1CQ8NER5 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
ACVR1CQ8NER5 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
ACVR1CQ8NER5 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
ACVR1CQ8NER5 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
ACVR1CQ8NER5 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
ACVR1CQ8NER5 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
ACVR1CQ8NER5 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
ACVR1CQ8NER5 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
ACVR1CQ8NER5 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
ACVR1CQ8NER5 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
ACVR1CQ8NER5 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
ACVR1CQ8NER5 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
ACVR1CQ8NER5 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
ACVR1CQ8NER5 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
ACVR1CQ8NER5 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
ACVR1CQ8NER5 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
ACVR1CQ8NER5 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
ACVR1CQ8NER5 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
ACVR1CQ8NER5 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
ACVR1CQ8NER5 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
ACVR1CQ8NER5 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
ACVR1CQ8NER5 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
ACVR1CQ8NER5 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
ACVR1CQ8NER5 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
ACVR1CQ8NER5 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
ACVR1CQ8NER5 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
ACVR1CQ8NER5 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
ACVR1CQ8NER5 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
ACVR1CQ8NER5 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
ACVR1CQ8NER5 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
ACVR1CQ8NER5 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
ACVR1CQ8NER5 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
ACVR1CQ8NER5 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
ACVR1CQ8NER5 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
ACVR1CQ8NER5 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
ACVR1CQ8NER5 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
ACVR1CQ8NER5 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
ACVR1CQ8NER5 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
ACVR1CQ8NER5 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
ACVR1CQ8NER5 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
ACVR1CQ8NER5 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
ACVR1CQ8NER5 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
ACVR1CQ8NER5 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
ACVR1CQ8NER5 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
ACVR1CQ8NER5 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ACVR1CQ8NER5 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
ACVR1CQ8NER5 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.8 ms