Protein–RNA interactions for Protein: Q8NE62

CHDH, Choline dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 594 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHDHQ8NE62 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CHDHQ8NE62 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CHDHQ8NE62 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
CHDHQ8NE62 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CHDHQ8NE62 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CHDHQ8NE62 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CHDHQ8NE62 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CHDHQ8NE62 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CHDHQ8NE62 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CHDHQ8NE62 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CHDHQ8NE62 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CHDHQ8NE62 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CHDHQ8NE62 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
CHDHQ8NE62 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CHDHQ8NE62 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CHDHQ8NE62 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CHDHQ8NE62 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CHDHQ8NE62 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CHDHQ8NE62 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CHDHQ8NE62 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CHDHQ8NE62 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CHDHQ8NE62 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CHDHQ8NE62 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CHDHQ8NE62 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CHDHQ8NE62 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CHDHQ8NE62 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CHDHQ8NE62 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CHDHQ8NE62 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CHDHQ8NE62 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CHDHQ8NE62 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CHDHQ8NE62 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CHDHQ8NE62 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CHDHQ8NE62 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CHDHQ8NE62 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CHDHQ8NE62 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CHDHQ8NE62 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CHDHQ8NE62 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CHDHQ8NE62 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CHDHQ8NE62 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CHDHQ8NE62 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CHDHQ8NE62 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CHDHQ8NE62 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CHDHQ8NE62 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CHDHQ8NE62 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CHDHQ8NE62 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CHDHQ8NE62 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CHDHQ8NE62 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CHDHQ8NE62 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CHDHQ8NE62 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CHDHQ8NE62 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CHDHQ8NE62 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CHDHQ8NE62 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
CHDHQ8NE62 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CHDHQ8NE62 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CHDHQ8NE62 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
CHDHQ8NE62 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CHDHQ8NE62 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CHDHQ8NE62 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CHDHQ8NE62 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CHDHQ8NE62 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CHDHQ8NE62 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CHDHQ8NE62 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CHDHQ8NE62 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CHDHQ8NE62 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CHDHQ8NE62 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CHDHQ8NE62 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CHDHQ8NE62 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CHDHQ8NE62 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CHDHQ8NE62 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CHDHQ8NE62 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CHDHQ8NE62 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CHDHQ8NE62 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
CHDHQ8NE62 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CHDHQ8NE62 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CHDHQ8NE62 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CHDHQ8NE62 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CHDHQ8NE62 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
CHDHQ8NE62 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CHDHQ8NE62 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CHDHQ8NE62 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CHDHQ8NE62 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CHDHQ8NE62 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CHDHQ8NE62 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CHDHQ8NE62 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CHDHQ8NE62 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CHDHQ8NE62 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CHDHQ8NE62 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CHDHQ8NE62 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CHDHQ8NE62 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CHDHQ8NE62 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CHDHQ8NE62 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CHDHQ8NE62 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CHDHQ8NE62 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CHDHQ8NE62 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CHDHQ8NE62 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CHDHQ8NE62 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CHDHQ8NE62 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CHDHQ8NE62 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CHDHQ8NE62 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CHDHQ8NE62 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.9 ms