Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9Z2

CCDC71L, Coiled-coil domain-containing protein 71L, humanhuman

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC71LQ8N9Z2 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC71LQ8N9Z2 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC71LQ8N9Z2 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC71LQ8N9Z2 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC71LQ8N9Z2 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC71LQ8N9Z2 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC71LQ8N9Z2 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC71LQ8N9Z2 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC71LQ8N9Z2 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC71LQ8N9Z2 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC71LQ8N9Z2 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC71LQ8N9Z2 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC71LQ8N9Z2 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC71LQ8N9Z2 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC71LQ8N9Z2 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC71LQ8N9Z2 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC71LQ8N9Z2 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC71LQ8N9Z2 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC71LQ8N9Z2 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC71LQ8N9Z2 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
CCDC71LQ8N9Z2 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC71LQ8N9Z2 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC71LQ8N9Z2 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC71LQ8N9Z2 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC71LQ8N9Z2 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC71LQ8N9Z2 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC71LQ8N9Z2 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC71LQ8N9Z2 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC71LQ8N9Z2 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC71LQ8N9Z2 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC71LQ8N9Z2 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC71LQ8N9Z2 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC71LQ8N9Z2 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CCDC71LQ8N9Z2 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC71LQ8N9Z2 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC71LQ8N9Z2 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC71LQ8N9Z2 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC71LQ8N9Z2 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC71LQ8N9Z2 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC71LQ8N9Z2 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC71LQ8N9Z2 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC71LQ8N9Z2 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC71LQ8N9Z2 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC71LQ8N9Z2 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC71LQ8N9Z2 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC71LQ8N9Z2 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC71LQ8N9Z2 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC71LQ8N9Z2 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CCDC71LQ8N9Z2 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC71LQ8N9Z2 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC71LQ8N9Z2 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC71LQ8N9Z2 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC71LQ8N9Z2 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC71LQ8N9Z2 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC71LQ8N9Z2 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC71LQ8N9Z2 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC71LQ8N9Z2 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC71LQ8N9Z2 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC71LQ8N9Z2 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC71LQ8N9Z2 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC71LQ8N9Z2 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC71LQ8N9Z2 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC71LQ8N9Z2 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC71LQ8N9Z2 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC71LQ8N9Z2 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC71LQ8N9Z2 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC71LQ8N9Z2 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC71LQ8N9Z2 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC71LQ8N9Z2 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC71LQ8N9Z2 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC71LQ8N9Z2 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC71LQ8N9Z2 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC71LQ8N9Z2 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC71LQ8N9Z2 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC71LQ8N9Z2 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC71LQ8N9Z2 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC71LQ8N9Z2 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC71LQ8N9Z2 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC71LQ8N9Z2 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC71LQ8N9Z2 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC71LQ8N9Z2 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC71LQ8N9Z2 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC71LQ8N9Z2 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC71LQ8N9Z2 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC71LQ8N9Z2 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC71LQ8N9Z2 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC71LQ8N9Z2 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC71LQ8N9Z2 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC71LQ8N9Z2 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC71LQ8N9Z2 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC71LQ8N9Z2 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC71LQ8N9Z2 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC71LQ8N9Z2 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC71LQ8N9Z2 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC71LQ8N9Z2 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC71LQ8N9Z2 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC71LQ8N9Z2 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC71LQ8N9Z2 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC71LQ8N9Z2 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC71LQ8N9Z2 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms