Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9I9

DTX3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase DTX3, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DTX3Q8N9I9 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
DTX3Q8N9I9 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
DTX3Q8N9I9 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
DTX3Q8N9I9 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
DTX3Q8N9I9 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
DTX3Q8N9I9 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
DTX3Q8N9I9 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
DTX3Q8N9I9 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
DTX3Q8N9I9 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
DTX3Q8N9I9 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
DTX3Q8N9I9 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
DTX3Q8N9I9 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
DTX3Q8N9I9 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
DTX3Q8N9I9 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
DTX3Q8N9I9 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
DTX3Q8N9I9 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
DTX3Q8N9I9 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
DTX3Q8N9I9 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
DTX3Q8N9I9 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
DTX3Q8N9I9 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
DTX3Q8N9I9 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
DTX3Q8N9I9 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
DTX3Q8N9I9 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
DTX3Q8N9I9 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
DTX3Q8N9I9 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
DTX3Q8N9I9 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
DTX3Q8N9I9 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
DTX3Q8N9I9 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
DTX3Q8N9I9 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
DTX3Q8N9I9 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
DTX3Q8N9I9 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
DTX3Q8N9I9 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
DTX3Q8N9I9 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
DTX3Q8N9I9 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
DTX3Q8N9I9 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
DTX3Q8N9I9 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
DTX3Q8N9I9 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
DTX3Q8N9I9 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
DTX3Q8N9I9 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
DTX3Q8N9I9 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
DTX3Q8N9I9 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
DTX3Q8N9I9 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
DTX3Q8N9I9 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
DTX3Q8N9I9 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
DTX3Q8N9I9 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
DTX3Q8N9I9 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
DTX3Q8N9I9 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
DTX3Q8N9I9 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
DTX3Q8N9I9 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
DTX3Q8N9I9 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
DTX3Q8N9I9 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
DTX3Q8N9I9 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
DTX3Q8N9I9 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
DTX3Q8N9I9 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
DTX3Q8N9I9 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
DTX3Q8N9I9 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
DTX3Q8N9I9 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
DTX3Q8N9I9 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
DTX3Q8N9I9 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
DTX3Q8N9I9 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
DTX3Q8N9I9 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
DTX3Q8N9I9 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
DTX3Q8N9I9 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
DTX3Q8N9I9 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
DTX3Q8N9I9 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
DTX3Q8N9I9 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
DTX3Q8N9I9 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
DTX3Q8N9I9 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
DTX3Q8N9I9 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
DTX3Q8N9I9 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
DTX3Q8N9I9 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
DTX3Q8N9I9 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
DTX3Q8N9I9 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
DTX3Q8N9I9 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
DTX3Q8N9I9 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
DTX3Q8N9I9 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
DTX3Q8N9I9 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
DTX3Q8N9I9 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
DTX3Q8N9I9 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
DTX3Q8N9I9 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
DTX3Q8N9I9 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
DTX3Q8N9I9 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
DTX3Q8N9I9 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
DTX3Q8N9I9 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
DTX3Q8N9I9 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
DTX3Q8N9I9 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
DTX3Q8N9I9 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
DTX3Q8N9I9 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
DTX3Q8N9I9 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
DTX3Q8N9I9 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
DTX3Q8N9I9 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
DTX3Q8N9I9 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
DTX3Q8N9I9 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
DTX3Q8N9I9 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
DTX3Q8N9I9 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
DTX3Q8N9I9 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
DTX3Q8N9I9 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
DTX3Q8N9I9 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
DTX3Q8N9I9 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
DTX3Q8N9I9 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms