Protein–RNA interactions for Protein: Q8IV31

TMEM139, Transmembrane protein 139, humanhuman

Predictions only

Length 216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM139Q8IV31 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
TMEM139Q8IV31 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
TMEM139Q8IV31 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
TMEM139Q8IV31 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
TMEM139Q8IV31 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
TMEM139Q8IV31 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC29.55■■■□□ 2.32
TMEM139Q8IV31 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC29.55■■■□□ 2.32
TMEM139Q8IV31 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
TMEM139Q8IV31 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
TMEM139Q8IV31 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
TMEM139Q8IV31 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
TMEM139Q8IV31 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
TMEM139Q8IV31 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
TMEM139Q8IV31 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
TMEM139Q8IV31 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
TMEM139Q8IV31 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
TMEM139Q8IV31 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
TMEM139Q8IV31 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
TMEM139Q8IV31 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
TMEM139Q8IV31 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
TMEM139Q8IV31 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
TMEM139Q8IV31 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
TMEM139Q8IV31 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
TMEM139Q8IV31 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
TMEM139Q8IV31 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
TMEM139Q8IV31 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
TMEM139Q8IV31 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
TMEM139Q8IV31 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
TMEM139Q8IV31 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
TMEM139Q8IV31 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
TMEM139Q8IV31 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
TMEM139Q8IV31 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
TMEM139Q8IV31 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
TMEM139Q8IV31 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
TMEM139Q8IV31 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
TMEM139Q8IV31 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
TMEM139Q8IV31 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
TMEM139Q8IV31 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
TMEM139Q8IV31 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
TMEM139Q8IV31 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
TMEM139Q8IV31 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
TMEM139Q8IV31 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
TMEM139Q8IV31 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
TMEM139Q8IV31 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
TMEM139Q8IV31 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
TMEM139Q8IV31 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
TMEM139Q8IV31 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
TMEM139Q8IV31 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
TMEM139Q8IV31 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
TMEM139Q8IV31 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
TMEM139Q8IV31 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
TMEM139Q8IV31 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
TMEM139Q8IV31 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC29.23■■■□□ 2.27
TMEM139Q8IV31 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
TMEM139Q8IV31 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
TMEM139Q8IV31 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
TMEM139Q8IV31 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
TMEM139Q8IV31 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
TMEM139Q8IV31 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
TMEM139Q8IV31 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
TMEM139Q8IV31 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC29.18■■■□□ 2.26
TMEM139Q8IV31 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
TMEM139Q8IV31 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
TMEM139Q8IV31 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
TMEM139Q8IV31 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
TMEM139Q8IV31 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
TMEM139Q8IV31 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
TMEM139Q8IV31 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
TMEM139Q8IV31 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
TMEM139Q8IV31 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
TMEM139Q8IV31 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
TMEM139Q8IV31 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
TMEM139Q8IV31 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC29.14■■■□□ 2.26
TMEM139Q8IV31 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
TMEM139Q8IV31 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
TMEM139Q8IV31 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
TMEM139Q8IV31 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
TMEM139Q8IV31 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
TMEM139Q8IV31 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
TMEM139Q8IV31 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC29.11■■■□□ 2.25
TMEM139Q8IV31 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
TMEM139Q8IV31 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
TMEM139Q8IV31 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
TMEM139Q8IV31 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
TMEM139Q8IV31 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
TMEM139Q8IV31 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
TMEM139Q8IV31 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
TMEM139Q8IV31 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
TMEM139Q8IV31 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
TMEM139Q8IV31 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
TMEM139Q8IV31 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
TMEM139Q8IV31 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
TMEM139Q8IV31 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
TMEM139Q8IV31 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
TMEM139Q8IV31 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
TMEM139Q8IV31 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
TMEM139Q8IV31 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
TMEM139Q8IV31 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
TMEM139Q8IV31 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
TMEM139Q8IV31 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.2 ms