Protein–RNA interactions for Protein: Q76N89

HECW1, E3 ubiquitin-protein ligase HECW1, humanhuman

Predictions only

Length 1,606 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HECW1Q76N89 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC43.18■■■■■ 4.5
HECW1Q76N89 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.16■■■■■ 4.5
HECW1Q76N89 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC43.16■■■■■ 4.5
HECW1Q76N89 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.14■■■■■ 4.5
HECW1Q76N89 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.13■■■■■ 4.5
HECW1Q76N89 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.12■■■■■ 4.49
HECW1Q76N89 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC43.11■■■■■ 4.49
HECW1Q76N89 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC43.11■■■■■ 4.49
HECW1Q76N89 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC43.11■■■■■ 4.49
HECW1Q76N89 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.1■■■■■ 4.49
HECW1Q76N89 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC43.09■■■■■ 4.49
HECW1Q76N89 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC43.09■■■■■ 4.49
HECW1Q76N89 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC43.09■■■■■ 4.49
HECW1Q76N89 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.09■■■■■ 4.49
HECW1Q76N89 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.08■■■■■ 4.49
HECW1Q76N89 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC43.08■■■■■ 4.49
HECW1Q76N89 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC43.08■■■■■ 4.49
HECW1Q76N89 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC43.05■■■■■ 4.48
HECW1Q76N89 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC43.04■■■■■ 4.48
HECW1Q76N89 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.02■■■■■ 4.48
HECW1Q76N89 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC43.02■■■■■ 4.48
HECW1Q76N89 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC43■■■■■ 4.47
HECW1Q76N89 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43■■■■■ 4.47
HECW1Q76N89 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.99■■■■■ 4.47
HECW1Q76N89 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.97■■■■■ 4.47
HECW1Q76N89 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC42.94■■■■■ 4.46
HECW1Q76N89 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC42.94■■■■■ 4.46
HECW1Q76N89 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.93■■■■■ 4.46
HECW1Q76N89 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC42.93■■■■■ 4.46
HECW1Q76N89 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC42.9■■■■■ 4.46
HECW1Q76N89 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC42.9■■■■■ 4.46
HECW1Q76N89 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC42.9■■■■■ 4.46
HECW1Q76N89 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC42.89■■■■■ 4.46
HECW1Q76N89 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.88■■■■■ 4.46
HECW1Q76N89 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.88■■■■■ 4.45
HECW1Q76N89 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC42.88■■■■■ 4.45
HECW1Q76N89 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC42.88■■■■■ 4.45
HECW1Q76N89 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.87■■■■■ 4.45
HECW1Q76N89 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC42.87■■■■■ 4.45
HECW1Q76N89 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC42.86■■■■■ 4.45
HECW1Q76N89 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC42.85■■■■■ 4.45
HECW1Q76N89 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC42.85■■■■■ 4.45
HECW1Q76N89 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC42.83■■■■■ 4.45
HECW1Q76N89 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.82■■■■■ 4.44
HECW1Q76N89 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.82■■■■■ 4.44
HECW1Q76N89 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC42.82■■■■■ 4.44
HECW1Q76N89 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC42.81■■■■■ 4.44
HECW1Q76N89 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC42.8■■■■■ 4.44
HECW1Q76N89 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC42.79■■■■■ 4.44
HECW1Q76N89 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC42.78■■■■■ 4.44
HECW1Q76N89 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC42.77■■■■■ 4.44
HECW1Q76N89 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.77■■■■■ 4.44
HECW1Q76N89 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC42.77■■■■■ 4.44
HECW1Q76N89 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC42.76■■■■■ 4.44
HECW1Q76N89 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC42.75■■■■■ 4.43
HECW1Q76N89 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.74■■■■■ 4.43
HECW1Q76N89 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC42.74■■■■■ 4.43
HECW1Q76N89 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC42.74■■■■■ 4.43
HECW1Q76N89 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.73■■■■■ 4.43
HECW1Q76N89 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC42.72■■■■■ 4.43
HECW1Q76N89 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.71■■■■■ 4.43
HECW1Q76N89 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC42.71■■■■■ 4.43
HECW1Q76N89 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC42.69■■■■■ 4.42
HECW1Q76N89 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC42.68■■■■■ 4.42
HECW1Q76N89 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.67■■■■■ 4.42
HECW1Q76N89 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC42.67■■■■■ 4.42
HECW1Q76N89 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC42.62■■■■■ 4.41
HECW1Q76N89 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.62■■■■■ 4.41
HECW1Q76N89 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.61■■■■■ 4.41
HECW1Q76N89 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC42.61■■■■■ 4.41
HECW1Q76N89 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC42.6■■■■■ 4.41
HECW1Q76N89 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC42.6■■■■■ 4.41
HECW1Q76N89 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.59■■■■■ 4.41
HECW1Q76N89 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.57■■■■■ 4.41
HECW1Q76N89 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC42.57■■■■■ 4.41
HECW1Q76N89 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.57■■■■■ 4.4
HECW1Q76N89 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC42.57■■■■■ 4.4
HECW1Q76N89 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC42.57■■■■■ 4.4
HECW1Q76N89 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC42.56■■■■■ 4.4
HECW1Q76N89 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC42.54■■■■■ 4.4
HECW1Q76N89 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.53■■■■■ 4.4
HECW1Q76N89 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.53■■■■■ 4.4
HECW1Q76N89 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.52■■■■■ 4.4
HECW1Q76N89 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC42.52■■■■■ 4.4
HECW1Q76N89 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC42.52■■■■■ 4.4
HECW1Q76N89 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.51■■■■■ 4.4
HECW1Q76N89 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.51■■■■■ 4.4
HECW1Q76N89 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC42.51■■■■■ 4.4
HECW1Q76N89 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.5■■■■■ 4.39
HECW1Q76N89 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.5■■■■■ 4.39
HECW1Q76N89 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC42.48■■■■■ 4.39
HECW1Q76N89 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC42.48■■■■■ 4.39
HECW1Q76N89 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.47■■■■■ 4.39
HECW1Q76N89 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC42.47■■■■■ 4.39
HECW1Q76N89 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.47■■■■■ 4.39
HECW1Q76N89 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.47■■■■■ 4.39
HECW1Q76N89 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC42.47■■■■■ 4.39
HECW1Q76N89 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.47■■■■■ 4.39
HECW1Q76N89 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC42.46■■■■■ 4.39
HECW1Q76N89 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC42.45■■■■■ 4.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms