Protein–RNA interactions for Protein: Q76N89

HECW1, E3 ubiquitin-protein ligase HECW1, humanhuman

Predictions only

Length 1,606 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HECW1Q76N89 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC54.64■■■■■ 6.34
HECW1Q76N89 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC53.87■■■■■ 6.21
HECW1Q76N89 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC53.25■■■■■ 6.12
HECW1Q76N89 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC53.04■■■■■ 6.08
HECW1Q76N89 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC52.93■■■■■ 6.06
HECW1Q76N89 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC52.69■■■■■ 6.03
HECW1Q76N89 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC52.67■■■■■ 6.02
HECW1Q76N89 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC52.36■■■■■ 5.97
HECW1Q76N89 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC51.54■■■■■ 5.84
HECW1Q76N89 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC51.44■■■■■ 5.83
HECW1Q76N89 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC51.4■■■■■ 5.82
HECW1Q76N89 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC51.4■■■■■ 5.82
HECW1Q76N89 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC51.2■■■■■ 5.79
HECW1Q76N89 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC51.13■■■■■ 5.78
HECW1Q76N89 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC50.95■■■■■ 5.75
HECW1Q76N89 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC50.86■■■■■ 5.73
HECW1Q76N89 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC50.77■■■■■ 5.72
HECW1Q76N89 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC50.76■■■■■ 5.72
HECW1Q76N89 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.47■■■■■ 5.67
HECW1Q76N89 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC50.32■■■■■ 5.65
HECW1Q76N89 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.22■■■■■ 5.63
HECW1Q76N89 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC50.15■■■■■ 5.62
HECW1Q76N89 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.14■■■■■ 5.62
HECW1Q76N89 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC50.04■■■■■ 5.6
HECW1Q76N89 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.96■■■■■ 5.59
HECW1Q76N89 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC49.96■■■■■ 5.59
HECW1Q76N89 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.82■■■■■ 5.57
HECW1Q76N89 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC49.72■■■■■ 5.55
HECW1Q76N89 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC49.41■■■■■ 5.5
HECW1Q76N89 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC49.4■■■■■ 5.5
HECW1Q76N89 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.31■■■■■ 5.48
HECW1Q76N89 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC49.28■■■■■ 5.48
HECW1Q76N89 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.21■■■■■ 5.47
HECW1Q76N89 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC49.05■■■■■ 5.44
HECW1Q76N89 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC48.9■■■■■ 5.42
HECW1Q76N89 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC48.83■■■■■ 5.41
HECW1Q76N89 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC48.76■■■■■ 5.4
HECW1Q76N89 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC48.76■■■■■ 5.4
HECW1Q76N89 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC48.76■■■■■ 5.4
HECW1Q76N89 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC48.69■■■■■ 5.38
HECW1Q76N89 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC48.61■■■■■ 5.37
HECW1Q76N89 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC48.6■■■■■ 5.37
HECW1Q76N89 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC48.36■■■■■ 5.33
HECW1Q76N89 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC48.35■■■■■ 5.33
HECW1Q76N89 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.35■■■■■ 5.33
HECW1Q76N89 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC48.18■■■■■ 5.3
HECW1Q76N89 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC48.12■■■■■ 5.29
HECW1Q76N89 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC48.01■■■■■ 5.28
HECW1Q76N89 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.96■■■■■ 5.27
HECW1Q76N89 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC47.94■■■■■ 5.27
HECW1Q76N89 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC47.79■■■■■ 5.24
HECW1Q76N89 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC47.49■■■■■ 5.19
HECW1Q76N89 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.49■■■■■ 5.19
HECW1Q76N89 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC47.48■■■■■ 5.19
HECW1Q76N89 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC47.41■■■■■ 5.18
HECW1Q76N89 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC47.4■■■■■ 5.18
HECW1Q76N89 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC47.39■■■■■ 5.18
HECW1Q76N89 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC47.39■■■■■ 5.18
HECW1Q76N89 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.36■■■■■ 5.17
HECW1Q76N89 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC47.31■■■■■ 5.16
HECW1Q76N89 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.27■■■■■ 5.16
HECW1Q76N89 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.24■■■■■ 5.15
HECW1Q76N89 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC47.18■■■■■ 5.14
HECW1Q76N89 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC47.18■■■■■ 5.14
HECW1Q76N89 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.14■■■■■ 5.14
HECW1Q76N89 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC47.14■■■■■ 5.14
HECW1Q76N89 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC47.13■■■■■ 5.14
HECW1Q76N89 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC47.12■■■■■ 5.13
HECW1Q76N89 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC47.1■■■■■ 5.13
HECW1Q76N89 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC47.06■■■■■ 5.12
HECW1Q76N89 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC47.05■■■■■ 5.12
HECW1Q76N89 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC47.03■■■■■ 5.12
HECW1Q76N89 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC47.03■■■■■ 5.12
HECW1Q76N89 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC47.02■■■■■ 5.12
HECW1Q76N89 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC47■■■■■ 5.11
HECW1Q76N89 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC47■■■■■ 5.11
HECW1Q76N89 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.99■■■■■ 5.11
HECW1Q76N89 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC46.95■■■■■ 5.11
HECW1Q76N89 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC46.93■■■■■ 5.1
HECW1Q76N89 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC46.9■■■■■ 5.1
HECW1Q76N89 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC46.88■■■■■ 5.1
HECW1Q76N89 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC46.84■■■■■ 5.09
HECW1Q76N89 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.83■■■■■ 5.09
HECW1Q76N89 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.79■■■■■ 5.08
HECW1Q76N89 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC46.74■■■■■ 5.07
HECW1Q76N89 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC46.72■■■■■ 5.07
HECW1Q76N89 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC46.68■■■■■ 5.06
HECW1Q76N89 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.68■■■■■ 5.06
HECW1Q76N89 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC46.68■■■■■ 5.06
HECW1Q76N89 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC46.67■■■■■ 5.06
HECW1Q76N89 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC46.65■■■■■ 5.06
HECW1Q76N89 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC46.64■■■■■ 5.06
HECW1Q76N89 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.58■■■■■ 5.05
HECW1Q76N89 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.46■■■■■ 5.03
HECW1Q76N89 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC46.46■■■■■ 5.03
HECW1Q76N89 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.45■■■■■ 5.03
HECW1Q76N89 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC46.44■■■■■ 5.02
HECW1Q76N89 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.32■■■■■ 5.01
HECW1Q76N89 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC46.3■■■■■ 5
HECW1Q76N89 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC46.27■■■■■ 5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms