Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRK6

CCDC73, Coiled-coil domain-containing protein 73, humanhuman

Predictions only

Length 1,079 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC73Q6ZRK6 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC31.05■■■□□ 2.56
CCDC73Q6ZRK6 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.04■■■□□ 2.56
CCDC73Q6ZRK6 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
CCDC73Q6ZRK6 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC31.03■■■□□ 2.56
CCDC73Q6ZRK6 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
CCDC73Q6ZRK6 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC31.02■■■□□ 2.56
CCDC73Q6ZRK6 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
CCDC73Q6ZRK6 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
CCDC73Q6ZRK6 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
CCDC73Q6ZRK6 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
CCDC73Q6ZRK6 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC31■■■□□ 2.55
CCDC73Q6ZRK6 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
CCDC73Q6ZRK6 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC30.99■■■□□ 2.55
CCDC73Q6ZRK6 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
CCDC73Q6ZRK6 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC30.98■■■□□ 2.55
CCDC73Q6ZRK6 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
CCDC73Q6ZRK6 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
CCDC73Q6ZRK6 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.92■■■□□ 2.54
CCDC73Q6ZRK6 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
CCDC73Q6ZRK6 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
CCDC73Q6ZRK6 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
CCDC73Q6ZRK6 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC30.87■■■□□ 2.53
CCDC73Q6ZRK6 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC30.87■■■□□ 2.53
CCDC73Q6ZRK6 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
CCDC73Q6ZRK6 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
CCDC73Q6ZRK6 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
CCDC73Q6ZRK6 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
CCDC73Q6ZRK6 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.83■■■□□ 2.53
CCDC73Q6ZRK6 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
CCDC73Q6ZRK6 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
CCDC73Q6ZRK6 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC30.83■■■□□ 2.53
CCDC73Q6ZRK6 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.82■■■□□ 2.52
CCDC73Q6ZRK6 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
CCDC73Q6ZRK6 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
CCDC73Q6ZRK6 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
CCDC73Q6ZRK6 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
CCDC73Q6ZRK6 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
CCDC73Q6ZRK6 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC30.79■■■□□ 2.52
CCDC73Q6ZRK6 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
CCDC73Q6ZRK6 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
CCDC73Q6ZRK6 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
CCDC73Q6ZRK6 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC30.78■■■□□ 2.52
CCDC73Q6ZRK6 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC30.77■■■□□ 2.52
CCDC73Q6ZRK6 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
CCDC73Q6ZRK6 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC30.77■■■□□ 2.52
CCDC73Q6ZRK6 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.76■■■□□ 2.52
CCDC73Q6ZRK6 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.75■■■□□ 2.51
CCDC73Q6ZRK6 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
CCDC73Q6ZRK6 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.75■■■□□ 2.51
CCDC73Q6ZRK6 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
CCDC73Q6ZRK6 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
CCDC73Q6ZRK6 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
CCDC73Q6ZRK6 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC30.74■■■□□ 2.51
CCDC73Q6ZRK6 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
CCDC73Q6ZRK6 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.73■■■□□ 2.51
CCDC73Q6ZRK6 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
CCDC73Q6ZRK6 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
CCDC73Q6ZRK6 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
CCDC73Q6ZRK6 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
CCDC73Q6ZRK6 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC30.71■■■□□ 2.51
CCDC73Q6ZRK6 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
CCDC73Q6ZRK6 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
CCDC73Q6ZRK6 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
CCDC73Q6ZRK6 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
CCDC73Q6ZRK6 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
CCDC73Q6ZRK6 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC30.64■■■□□ 2.5
CCDC73Q6ZRK6 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
CCDC73Q6ZRK6 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC30.63■■■□□ 2.49
CCDC73Q6ZRK6 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC30.63■■■□□ 2.49
CCDC73Q6ZRK6 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
CCDC73Q6ZRK6 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
CCDC73Q6ZRK6 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
CCDC73Q6ZRK6 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC30.62■■■□□ 2.49
CCDC73Q6ZRK6 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
CCDC73Q6ZRK6 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.62■■■□□ 2.49
CCDC73Q6ZRK6 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
CCDC73Q6ZRK6 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC30.6■■■□□ 2.49
CCDC73Q6ZRK6 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
CCDC73Q6ZRK6 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.58■■■□□ 2.49
CCDC73Q6ZRK6 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
CCDC73Q6ZRK6 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.49
CCDC73Q6ZRK6 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
CCDC73Q6ZRK6 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
CCDC73Q6ZRK6 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
CCDC73Q6ZRK6 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
CCDC73Q6ZRK6 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
CCDC73Q6ZRK6 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
CCDC73Q6ZRK6 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC30.56■■■□□ 2.48
CCDC73Q6ZRK6 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
CCDC73Q6ZRK6 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.54■■■□□ 2.48
CCDC73Q6ZRK6 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
CCDC73Q6ZRK6 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC30.53■■■□□ 2.48
CCDC73Q6ZRK6 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC30.53■■■□□ 2.48
CCDC73Q6ZRK6 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
CCDC73Q6ZRK6 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
CCDC73Q6ZRK6 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
CCDC73Q6ZRK6 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC30.5■■■□□ 2.47
CCDC73Q6ZRK6 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.5■■■□□ 2.47
CCDC73Q6ZRK6 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.5■■■□□ 2.47
CCDC73Q6ZRK6 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC30.49■■■□□ 2.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms