Protein–RNA interactions for Protein: Q6RUI8

C19orf48, Uncharacterized protein C19orf48, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C19orf48Q6RUI8 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
C19orf48Q6RUI8 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
C19orf48Q6RUI8 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
C19orf48Q6RUI8 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
C19orf48Q6RUI8 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
C19orf48Q6RUI8 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
C19orf48Q6RUI8 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
C19orf48Q6RUI8 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
C19orf48Q6RUI8 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
C19orf48Q6RUI8 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
C19orf48Q6RUI8 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
C19orf48Q6RUI8 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
C19orf48Q6RUI8 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
C19orf48Q6RUI8 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
C19orf48Q6RUI8 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
C19orf48Q6RUI8 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
C19orf48Q6RUI8 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
C19orf48Q6RUI8 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
C19orf48Q6RUI8 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
C19orf48Q6RUI8 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC26.25■■□□□ 1.79
C19orf48Q6RUI8 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
C19orf48Q6RUI8 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
C19orf48Q6RUI8 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC26.24■■□□□ 1.79
C19orf48Q6RUI8 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
C19orf48Q6RUI8 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
C19orf48Q6RUI8 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
C19orf48Q6RUI8 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
C19orf48Q6RUI8 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
C19orf48Q6RUI8 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
C19orf48Q6RUI8 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
C19orf48Q6RUI8 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
C19orf48Q6RUI8 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
C19orf48Q6RUI8 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
C19orf48Q6RUI8 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
C19orf48Q6RUI8 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
C19orf48Q6RUI8 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
C19orf48Q6RUI8 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
C19orf48Q6RUI8 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
C19orf48Q6RUI8 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
C19orf48Q6RUI8 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
C19orf48Q6RUI8 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
C19orf48Q6RUI8 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC26.15■■□□□ 1.78
C19orf48Q6RUI8 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
C19orf48Q6RUI8 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
C19orf48Q6RUI8 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
C19orf48Q6RUI8 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
C19orf48Q6RUI8 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
C19orf48Q6RUI8 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
C19orf48Q6RUI8 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
C19orf48Q6RUI8 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
C19orf48Q6RUI8 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
C19orf48Q6RUI8 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
C19orf48Q6RUI8 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
C19orf48Q6RUI8 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
C19orf48Q6RUI8 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
C19orf48Q6RUI8 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
C19orf48Q6RUI8 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
C19orf48Q6RUI8 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
C19orf48Q6RUI8 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
C19orf48Q6RUI8 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
C19orf48Q6RUI8 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
C19orf48Q6RUI8 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
C19orf48Q6RUI8 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
C19orf48Q6RUI8 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC26.03■■□□□ 1.76
C19orf48Q6RUI8 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
C19orf48Q6RUI8 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
C19orf48Q6RUI8 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
C19orf48Q6RUI8 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
C19orf48Q6RUI8 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
C19orf48Q6RUI8 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
C19orf48Q6RUI8 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
C19orf48Q6RUI8 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
C19orf48Q6RUI8 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
C19orf48Q6RUI8 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
C19orf48Q6RUI8 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
C19orf48Q6RUI8 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
C19orf48Q6RUI8 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
C19orf48Q6RUI8 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
C19orf48Q6RUI8 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
C19orf48Q6RUI8 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
C19orf48Q6RUI8 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
C19orf48Q6RUI8 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
C19orf48Q6RUI8 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
C19orf48Q6RUI8 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
C19orf48Q6RUI8 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC25.92■■□□□ 1.74
C19orf48Q6RUI8 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
C19orf48Q6RUI8 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
C19orf48Q6RUI8 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
C19orf48Q6RUI8 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
C19orf48Q6RUI8 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
C19orf48Q6RUI8 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
C19orf48Q6RUI8 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
C19orf48Q6RUI8 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
C19orf48Q6RUI8 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
C19orf48Q6RUI8 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
C19orf48Q6RUI8 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
C19orf48Q6RUI8 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
C19orf48Q6RUI8 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
C19orf48Q6RUI8 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
C19orf48Q6RUI8 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms