Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXP2

FAM71F2, Protein FAM71F2, humanhuman

Predictions only

Length 309 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM71F2Q6NXP2 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FAM71F2Q6NXP2 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FAM71F2Q6NXP2 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FAM71F2Q6NXP2 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FAM71F2Q6NXP2 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
FAM71F2Q6NXP2 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FAM71F2Q6NXP2 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FAM71F2Q6NXP2 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FAM71F2Q6NXP2 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
FAM71F2Q6NXP2 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FAM71F2Q6NXP2 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FAM71F2Q6NXP2 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
FAM71F2Q6NXP2 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FAM71F2Q6NXP2 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
FAM71F2Q6NXP2 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
FAM71F2Q6NXP2 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
FAM71F2Q6NXP2 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
FAM71F2Q6NXP2 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
FAM71F2Q6NXP2 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
FAM71F2Q6NXP2 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
FAM71F2Q6NXP2 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
FAM71F2Q6NXP2 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
FAM71F2Q6NXP2 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
FAM71F2Q6NXP2 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
FAM71F2Q6NXP2 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
FAM71F2Q6NXP2 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
FAM71F2Q6NXP2 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
FAM71F2Q6NXP2 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
FAM71F2Q6NXP2 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC21.89■■□□□ 1.09
FAM71F2Q6NXP2 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
FAM71F2Q6NXP2 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
FAM71F2Q6NXP2 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
FAM71F2Q6NXP2 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
FAM71F2Q6NXP2 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
FAM71F2Q6NXP2 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
FAM71F2Q6NXP2 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
FAM71F2Q6NXP2 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
FAM71F2Q6NXP2 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
FAM71F2Q6NXP2 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FAM71F2Q6NXP2 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
FAM71F2Q6NXP2 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
FAM71F2Q6NXP2 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
FAM71F2Q6NXP2 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
FAM71F2Q6NXP2 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
FAM71F2Q6NXP2 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
FAM71F2Q6NXP2 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
FAM71F2Q6NXP2 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
FAM71F2Q6NXP2 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
FAM71F2Q6NXP2 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
FAM71F2Q6NXP2 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
FAM71F2Q6NXP2 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
FAM71F2Q6NXP2 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
FAM71F2Q6NXP2 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
FAM71F2Q6NXP2 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
FAM71F2Q6NXP2 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
FAM71F2Q6NXP2 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
FAM71F2Q6NXP2 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
FAM71F2Q6NXP2 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
FAM71F2Q6NXP2 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
FAM71F2Q6NXP2 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
FAM71F2Q6NXP2 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
FAM71F2Q6NXP2 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
FAM71F2Q6NXP2 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
FAM71F2Q6NXP2 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
FAM71F2Q6NXP2 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
FAM71F2Q6NXP2 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
FAM71F2Q6NXP2 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
FAM71F2Q6NXP2 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
FAM71F2Q6NXP2 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
FAM71F2Q6NXP2 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
FAM71F2Q6NXP2 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
FAM71F2Q6NXP2 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
FAM71F2Q6NXP2 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
FAM71F2Q6NXP2 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
FAM71F2Q6NXP2 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
FAM71F2Q6NXP2 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
FAM71F2Q6NXP2 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
FAM71F2Q6NXP2 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
FAM71F2Q6NXP2 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
FAM71F2Q6NXP2 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
FAM71F2Q6NXP2 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
FAM71F2Q6NXP2 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
FAM71F2Q6NXP2 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
FAM71F2Q6NXP2 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
FAM71F2Q6NXP2 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
FAM71F2Q6NXP2 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
FAM71F2Q6NXP2 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
FAM71F2Q6NXP2 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
FAM71F2Q6NXP2 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
FAM71F2Q6NXP2 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
FAM71F2Q6NXP2 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
FAM71F2Q6NXP2 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
FAM71F2Q6NXP2 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
FAM71F2Q6NXP2 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FAM71F2Q6NXP2 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FAM71F2Q6NXP2 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FAM71F2Q6NXP2 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
FAM71F2Q6NXP2 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
FAM71F2Q6NXP2 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
FAM71F2Q6NXP2 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms