Protein–RNA interactions for Protein: Q6NVV1

RPL13AP3, Putative 60S ribosomal protein L13a protein RPL13AP3, humanhuman

Predictions only

Length 102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL13AP3Q6NVV1 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RPL13AP3Q6NVV1 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RPL13AP3Q6NVV1 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RPL13AP3Q6NVV1 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RPL13AP3Q6NVV1 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RPL13AP3Q6NVV1 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RPL13AP3Q6NVV1 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RPL13AP3Q6NVV1 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RPL13AP3Q6NVV1 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RPL13AP3Q6NVV1 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RPL13AP3Q6NVV1 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RPL13AP3Q6NVV1 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RPL13AP3Q6NVV1 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RPL13AP3Q6NVV1 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RPL13AP3Q6NVV1 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RPL13AP3Q6NVV1 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
RPL13AP3Q6NVV1 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RPL13AP3Q6NVV1 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RPL13AP3Q6NVV1 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RPL13AP3Q6NVV1 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RPL13AP3Q6NVV1 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RPL13AP3Q6NVV1 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RPL13AP3Q6NVV1 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RPL13AP3Q6NVV1 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RPL13AP3Q6NVV1 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RPL13AP3Q6NVV1 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RPL13AP3Q6NVV1 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RPL13AP3Q6NVV1 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
RPL13AP3Q6NVV1 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RPL13AP3Q6NVV1 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RPL13AP3Q6NVV1 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RPL13AP3Q6NVV1 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
RPL13AP3Q6NVV1 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RPL13AP3Q6NVV1 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
RPL13AP3Q6NVV1 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RPL13AP3Q6NVV1 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RPL13AP3Q6NVV1 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RPL13AP3Q6NVV1 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RPL13AP3Q6NVV1 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RPL13AP3Q6NVV1 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RPL13AP3Q6NVV1 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RPL13AP3Q6NVV1 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RPL13AP3Q6NVV1 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RPL13AP3Q6NVV1 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RPL13AP3Q6NVV1 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RPL13AP3Q6NVV1 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RPL13AP3Q6NVV1 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RPL13AP3Q6NVV1 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RPL13AP3Q6NVV1 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RPL13AP3Q6NVV1 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RPL13AP3Q6NVV1 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RPL13AP3Q6NVV1 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RPL13AP3Q6NVV1 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RPL13AP3Q6NVV1 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
RPL13AP3Q6NVV1 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
RPL13AP3Q6NVV1 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RPL13AP3Q6NVV1 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RPL13AP3Q6NVV1 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RPL13AP3Q6NVV1 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RPL13AP3Q6NVV1 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RPL13AP3Q6NVV1 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RPL13AP3Q6NVV1 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RPL13AP3Q6NVV1 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
RPL13AP3Q6NVV1 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RPL13AP3Q6NVV1 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RPL13AP3Q6NVV1 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RPL13AP3Q6NVV1 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RPL13AP3Q6NVV1 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RPL13AP3Q6NVV1 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RPL13AP3Q6NVV1 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RPL13AP3Q6NVV1 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RPL13AP3Q6NVV1 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RPL13AP3Q6NVV1 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RPL13AP3Q6NVV1 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RPL13AP3Q6NVV1 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RPL13AP3Q6NVV1 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RPL13AP3Q6NVV1 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RPL13AP3Q6NVV1 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RPL13AP3Q6NVV1 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RPL13AP3Q6NVV1 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RPL13AP3Q6NVV1 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RPL13AP3Q6NVV1 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RPL13AP3Q6NVV1 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RPL13AP3Q6NVV1 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RPL13AP3Q6NVV1 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RPL13AP3Q6NVV1 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RPL13AP3Q6NVV1 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RPL13AP3Q6NVV1 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RPL13AP3Q6NVV1 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RPL13AP3Q6NVV1 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RPL13AP3Q6NVV1 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RPL13AP3Q6NVV1 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RPL13AP3Q6NVV1 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RPL13AP3Q6NVV1 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
RPL13AP3Q6NVV1 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
RPL13AP3Q6NVV1 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RPL13AP3Q6NVV1 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RPL13AP3Q6NVV1 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RPL13AP3Q6NVV1 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RPL13AP3Q6NVV1 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms