Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSJ5

LRRC8E, Volume-regulated anion channel subunit LRRC8E, humanhuman

Predictions only

Length 796 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC8EQ6NSJ5 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
LRRC8EQ6NSJ5 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
LRRC8EQ6NSJ5 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
LRRC8EQ6NSJ5 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
LRRC8EQ6NSJ5 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
LRRC8EQ6NSJ5 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
LRRC8EQ6NSJ5 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
LRRC8EQ6NSJ5 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
LRRC8EQ6NSJ5 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
LRRC8EQ6NSJ5 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
LRRC8EQ6NSJ5 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
LRRC8EQ6NSJ5 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
LRRC8EQ6NSJ5 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
LRRC8EQ6NSJ5 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
LRRC8EQ6NSJ5 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
LRRC8EQ6NSJ5 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
LRRC8EQ6NSJ5 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
LRRC8EQ6NSJ5 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
LRRC8EQ6NSJ5 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
LRRC8EQ6NSJ5 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
LRRC8EQ6NSJ5 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
LRRC8EQ6NSJ5 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
LRRC8EQ6NSJ5 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
LRRC8EQ6NSJ5 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
LRRC8EQ6NSJ5 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
LRRC8EQ6NSJ5 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
LRRC8EQ6NSJ5 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
LRRC8EQ6NSJ5 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
LRRC8EQ6NSJ5 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
LRRC8EQ6NSJ5 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
LRRC8EQ6NSJ5 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
LRRC8EQ6NSJ5 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
LRRC8EQ6NSJ5 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
LRRC8EQ6NSJ5 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
LRRC8EQ6NSJ5 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
LRRC8EQ6NSJ5 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
LRRC8EQ6NSJ5 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
LRRC8EQ6NSJ5 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
LRRC8EQ6NSJ5 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
LRRC8EQ6NSJ5 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
LRRC8EQ6NSJ5 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
LRRC8EQ6NSJ5 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
LRRC8EQ6NSJ5 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
LRRC8EQ6NSJ5 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
LRRC8EQ6NSJ5 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
LRRC8EQ6NSJ5 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
LRRC8EQ6NSJ5 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
LRRC8EQ6NSJ5 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
LRRC8EQ6NSJ5 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
LRRC8EQ6NSJ5 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
LRRC8EQ6NSJ5 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
LRRC8EQ6NSJ5 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
LRRC8EQ6NSJ5 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
LRRC8EQ6NSJ5 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
LRRC8EQ6NSJ5 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
LRRC8EQ6NSJ5 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
LRRC8EQ6NSJ5 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
LRRC8EQ6NSJ5 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
LRRC8EQ6NSJ5 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
LRRC8EQ6NSJ5 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
LRRC8EQ6NSJ5 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
LRRC8EQ6NSJ5 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
LRRC8EQ6NSJ5 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
LRRC8EQ6NSJ5 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
LRRC8EQ6NSJ5 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
LRRC8EQ6NSJ5 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
LRRC8EQ6NSJ5 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
LRRC8EQ6NSJ5 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
LRRC8EQ6NSJ5 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
LRRC8EQ6NSJ5 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
LRRC8EQ6NSJ5 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
LRRC8EQ6NSJ5 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
LRRC8EQ6NSJ5 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
LRRC8EQ6NSJ5 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
LRRC8EQ6NSJ5 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC26.62■■□□□ 1.85
LRRC8EQ6NSJ5 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
LRRC8EQ6NSJ5 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
LRRC8EQ6NSJ5 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
LRRC8EQ6NSJ5 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
LRRC8EQ6NSJ5 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
LRRC8EQ6NSJ5 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
LRRC8EQ6NSJ5 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
LRRC8EQ6NSJ5 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
LRRC8EQ6NSJ5 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
LRRC8EQ6NSJ5 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
LRRC8EQ6NSJ5 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
LRRC8EQ6NSJ5 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
LRRC8EQ6NSJ5 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
LRRC8EQ6NSJ5 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
LRRC8EQ6NSJ5 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
LRRC8EQ6NSJ5 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
LRRC8EQ6NSJ5 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
LRRC8EQ6NSJ5 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
LRRC8EQ6NSJ5 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
LRRC8EQ6NSJ5 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
LRRC8EQ6NSJ5 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
LRRC8EQ6NSJ5 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
LRRC8EQ6NSJ5 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
LRRC8EQ6NSJ5 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.84
LRRC8EQ6NSJ5 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.7 ms