Protein–RNA interactions for Protein: Q6EEV6

SUMO4, Small ubiquitin-related modifier 4, humanhuman

Predictions only

Length 95 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUMO4Q6EEV6 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SUMO4Q6EEV6 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SUMO4Q6EEV6 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SUMO4Q6EEV6 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SUMO4Q6EEV6 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SUMO4Q6EEV6 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SUMO4Q6EEV6 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SUMO4Q6EEV6 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SUMO4Q6EEV6 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SUMO4Q6EEV6 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SUMO4Q6EEV6 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SUMO4Q6EEV6 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SUMO4Q6EEV6 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SUMO4Q6EEV6 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SUMO4Q6EEV6 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SUMO4Q6EEV6 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SUMO4Q6EEV6 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SUMO4Q6EEV6 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SUMO4Q6EEV6 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
SUMO4Q6EEV6 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SUMO4Q6EEV6 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
SUMO4Q6EEV6 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SUMO4Q6EEV6 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SUMO4Q6EEV6 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SUMO4Q6EEV6 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
SUMO4Q6EEV6 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
SUMO4Q6EEV6 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
SUMO4Q6EEV6 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
SUMO4Q6EEV6 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
SUMO4Q6EEV6 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
SUMO4Q6EEV6 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
SUMO4Q6EEV6 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SUMO4Q6EEV6 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SUMO4Q6EEV6 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SUMO4Q6EEV6 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SUMO4Q6EEV6 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SUMO4Q6EEV6 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SUMO4Q6EEV6 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SUMO4Q6EEV6 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SUMO4Q6EEV6 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SUMO4Q6EEV6 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SUMO4Q6EEV6 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SUMO4Q6EEV6 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SUMO4Q6EEV6 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SUMO4Q6EEV6 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SUMO4Q6EEV6 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SUMO4Q6EEV6 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SUMO4Q6EEV6 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SUMO4Q6EEV6 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SUMO4Q6EEV6 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
SUMO4Q6EEV6 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SUMO4Q6EEV6 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SUMO4Q6EEV6 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SUMO4Q6EEV6 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SUMO4Q6EEV6 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SUMO4Q6EEV6 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SUMO4Q6EEV6 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SUMO4Q6EEV6 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SUMO4Q6EEV6 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SUMO4Q6EEV6 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
SUMO4Q6EEV6 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SUMO4Q6EEV6 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SUMO4Q6EEV6 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SUMO4Q6EEV6 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
SUMO4Q6EEV6 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SUMO4Q6EEV6 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SUMO4Q6EEV6 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
SUMO4Q6EEV6 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
SUMO4Q6EEV6 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SUMO4Q6EEV6 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SUMO4Q6EEV6 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SUMO4Q6EEV6 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SUMO4Q6EEV6 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SUMO4Q6EEV6 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
SUMO4Q6EEV6 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SUMO4Q6EEV6 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SUMO4Q6EEV6 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SUMO4Q6EEV6 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SUMO4Q6EEV6 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SUMO4Q6EEV6 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SUMO4Q6EEV6 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SUMO4Q6EEV6 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SUMO4Q6EEV6 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SUMO4Q6EEV6 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SUMO4Q6EEV6 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SUMO4Q6EEV6 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SUMO4Q6EEV6 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SUMO4Q6EEV6 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SUMO4Q6EEV6 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SUMO4Q6EEV6 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SUMO4Q6EEV6 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SUMO4Q6EEV6 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SUMO4Q6EEV6 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
SUMO4Q6EEV6 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SUMO4Q6EEV6 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SUMO4Q6EEV6 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SUMO4Q6EEV6 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SUMO4Q6EEV6 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SUMO4Q6EEV6 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SUMO4Q6EEV6 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms