Protein–RNA interactions for Protein: Q5VYK3

ECM29, Proteasome-associated protein ECM29 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,845 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM29Q5VYK3 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC33.06■■■□□ 2.88
ECM29Q5VYK3 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC33.05■■■□□ 2.88
ECM29Q5VYK3 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.02■■■□□ 2.88
ECM29Q5VYK3 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.02■■■□□ 2.88
ECM29Q5VYK3 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC33■■■□□ 2.87
ECM29Q5VYK3 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC33■■■□□ 2.87
ECM29Q5VYK3 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC33■■■□□ 2.87
ECM29Q5VYK3 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
ECM29Q5VYK3 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
ECM29Q5VYK3 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC32.98■■■□□ 2.87
ECM29Q5VYK3 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.97■■■□□ 2.87
ECM29Q5VYK3 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
ECM29Q5VYK3 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
ECM29Q5VYK3 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
ECM29Q5VYK3 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
ECM29Q5VYK3 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC32.94■■■□□ 2.86
ECM29Q5VYK3 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
ECM29Q5VYK3 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
ECM29Q5VYK3 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
ECM29Q5VYK3 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC32.92■■■□□ 2.86
ECM29Q5VYK3 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
ECM29Q5VYK3 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
ECM29Q5VYK3 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC32.91■■■□□ 2.86
ECM29Q5VYK3 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC32.89■■■□□ 2.86
ECM29Q5VYK3 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
ECM29Q5VYK3 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
ECM29Q5VYK3 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.88■■■□□ 2.85
ECM29Q5VYK3 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC32.87■■■□□ 2.85
ECM29Q5VYK3 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC32.87■■■□□ 2.85
ECM29Q5VYK3 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC32.86■■■□□ 2.85
ECM29Q5VYK3 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
ECM29Q5VYK3 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC32.85■■■□□ 2.85
ECM29Q5VYK3 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC32.85■■■□□ 2.85
ECM29Q5VYK3 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
ECM29Q5VYK3 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
ECM29Q5VYK3 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC32.84■■■□□ 2.85
ECM29Q5VYK3 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
ECM29Q5VYK3 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
ECM29Q5VYK3 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
ECM29Q5VYK3 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.8■■■□□ 2.84
ECM29Q5VYK3 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC32.8■■■□□ 2.84
ECM29Q5VYK3 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
ECM29Q5VYK3 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
ECM29Q5VYK3 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
ECM29Q5VYK3 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
ECM29Q5VYK3 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
ECM29Q5VYK3 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
ECM29Q5VYK3 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
ECM29Q5VYK3 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
ECM29Q5VYK3 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
ECM29Q5VYK3 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC32.73■■■□□ 2.83
ECM29Q5VYK3 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
ECM29Q5VYK3 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC32.72■■■□□ 2.83
ECM29Q5VYK3 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC32.71■■■□□ 2.83
ECM29Q5VYK3 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC32.7■■■□□ 2.83
ECM29Q5VYK3 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC32.7■■■□□ 2.82
ECM29Q5VYK3 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC32.69■■■□□ 2.82
ECM29Q5VYK3 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
ECM29Q5VYK3 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC32.68■■■□□ 2.82
ECM29Q5VYK3 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
ECM29Q5VYK3 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
ECM29Q5VYK3 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
ECM29Q5VYK3 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC32.65■■■□□ 2.82
ECM29Q5VYK3 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC32.64■■■□□ 2.82
ECM29Q5VYK3 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
ECM29Q5VYK3 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC32.63■■■□□ 2.81
ECM29Q5VYK3 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.62■■■□□ 2.81
ECM29Q5VYK3 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
ECM29Q5VYK3 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
ECM29Q5VYK3 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
ECM29Q5VYK3 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
ECM29Q5VYK3 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
ECM29Q5VYK3 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
ECM29Q5VYK3 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC32.59■■■□□ 2.81
ECM29Q5VYK3 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
ECM29Q5VYK3 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.81
ECM29Q5VYK3 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.57■■■□□ 2.8
ECM29Q5VYK3 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC32.57■■■□□ 2.8
ECM29Q5VYK3 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC32.56■■■□□ 2.8
ECM29Q5VYK3 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC32.56■■■□□ 2.8
ECM29Q5VYK3 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
ECM29Q5VYK3 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
ECM29Q5VYK3 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
ECM29Q5VYK3 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.55■■■□□ 2.8
ECM29Q5VYK3 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC32.53■■■□□ 2.8
ECM29Q5VYK3 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC32.53■■■□□ 2.8
ECM29Q5VYK3 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC32.51■■■□□ 2.8
ECM29Q5VYK3 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC32.51■■■□□ 2.79
ECM29Q5VYK3 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
ECM29Q5VYK3 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.48■■■□□ 2.79
ECM29Q5VYK3 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
ECM29Q5VYK3 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
ECM29Q5VYK3 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
ECM29Q5VYK3 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC32.46■■■□□ 2.79
ECM29Q5VYK3 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC32.46■■■□□ 2.79
ECM29Q5VYK3 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC32.45■■■□□ 2.79
ECM29Q5VYK3 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.78
ECM29Q5VYK3 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
ECM29Q5VYK3 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
ECM29Q5VYK3 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms