Protein–RNA interactions for Protein: Q5VYJ5

MALRD1, MAM and LDL-receptor class A domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MALRD1Q5VYJ5 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MALRD1Q5VYJ5 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MALRD1Q5VYJ5 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
MALRD1Q5VYJ5 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
MALRD1Q5VYJ5 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MALRD1Q5VYJ5 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
MALRD1Q5VYJ5 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MALRD1Q5VYJ5 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MALRD1Q5VYJ5 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MALRD1Q5VYJ5 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MALRD1Q5VYJ5 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MALRD1Q5VYJ5 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MALRD1Q5VYJ5 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MALRD1Q5VYJ5 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MALRD1Q5VYJ5 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MALRD1Q5VYJ5 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MALRD1Q5VYJ5 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MALRD1Q5VYJ5 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MALRD1Q5VYJ5 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MALRD1Q5VYJ5 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MALRD1Q5VYJ5 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MALRD1Q5VYJ5 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MALRD1Q5VYJ5 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MALRD1Q5VYJ5 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MALRD1Q5VYJ5 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MALRD1Q5VYJ5 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MALRD1Q5VYJ5 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MALRD1Q5VYJ5 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MALRD1Q5VYJ5 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MALRD1Q5VYJ5 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MALRD1Q5VYJ5 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MALRD1Q5VYJ5 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MALRD1Q5VYJ5 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MALRD1Q5VYJ5 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MALRD1Q5VYJ5 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
MALRD1Q5VYJ5 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.23
MALRD1Q5VYJ5 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
MALRD1Q5VYJ5 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MALRD1Q5VYJ5 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MALRD1Q5VYJ5 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MALRD1Q5VYJ5 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MALRD1Q5VYJ5 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MALRD1Q5VYJ5 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MALRD1Q5VYJ5 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MALRD1Q5VYJ5 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MALRD1Q5VYJ5 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MALRD1Q5VYJ5 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
MALRD1Q5VYJ5 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
MALRD1Q5VYJ5 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
MALRD1Q5VYJ5 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MALRD1Q5VYJ5 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MALRD1Q5VYJ5 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MALRD1Q5VYJ5 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MALRD1Q5VYJ5 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MALRD1Q5VYJ5 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MALRD1Q5VYJ5 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MALRD1Q5VYJ5 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MALRD1Q5VYJ5 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MALRD1Q5VYJ5 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MALRD1Q5VYJ5 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MALRD1Q5VYJ5 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MALRD1Q5VYJ5 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MALRD1Q5VYJ5 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MALRD1Q5VYJ5 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MALRD1Q5VYJ5 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MALRD1Q5VYJ5 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
MALRD1Q5VYJ5 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MALRD1Q5VYJ5 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MALRD1Q5VYJ5 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MALRD1Q5VYJ5 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MALRD1Q5VYJ5 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MALRD1Q5VYJ5 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MALRD1Q5VYJ5 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MALRD1Q5VYJ5 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
MALRD1Q5VYJ5 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MALRD1Q5VYJ5 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MALRD1Q5VYJ5 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MALRD1Q5VYJ5 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MALRD1Q5VYJ5 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MALRD1Q5VYJ5 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MALRD1Q5VYJ5 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MALRD1Q5VYJ5 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MALRD1Q5VYJ5 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MALRD1Q5VYJ5 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MALRD1Q5VYJ5 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MALRD1Q5VYJ5 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MALRD1Q5VYJ5 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MALRD1Q5VYJ5 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MALRD1Q5VYJ5 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MALRD1Q5VYJ5 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MALRD1Q5VYJ5 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MALRD1Q5VYJ5 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MALRD1Q5VYJ5 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MALRD1Q5VYJ5 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MALRD1Q5VYJ5 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MALRD1Q5VYJ5 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MALRD1Q5VYJ5 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MALRD1Q5VYJ5 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MALRD1Q5VYJ5 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MALRD1Q5VYJ5 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96.4 ms