Protein–RNA interactions for Protein: Q15669

RHOH, Rho-related GTP-binding protein RhoH, humanhuman

Predictions only

Length 191 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOHQ15669 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RHOHQ15669 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
RHOHQ15669 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
RHOHQ15669 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
RHOHQ15669 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
RHOHQ15669 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
RHOHQ15669 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
RHOHQ15669 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
RHOHQ15669 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
RHOHQ15669 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
RHOHQ15669 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
RHOHQ15669 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
RHOHQ15669 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
RHOHQ15669 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
RHOHQ15669 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
RHOHQ15669 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
RHOHQ15669 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
RHOHQ15669 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
RHOHQ15669 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
RHOHQ15669 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
RHOHQ15669 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
RHOHQ15669 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
RHOHQ15669 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
RHOHQ15669 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
RHOHQ15669 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
RHOHQ15669 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
RHOHQ15669 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
RHOHQ15669 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
RHOHQ15669 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
RHOHQ15669 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
RHOHQ15669 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
RHOHQ15669 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
RHOHQ15669 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
RHOHQ15669 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
RHOHQ15669 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
RHOHQ15669 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
RHOHQ15669 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
RHOHQ15669 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
RHOHQ15669 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
RHOHQ15669 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
RHOHQ15669 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
RHOHQ15669 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
RHOHQ15669 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
RHOHQ15669 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RHOHQ15669 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RHOHQ15669 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RHOHQ15669 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RHOHQ15669 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RHOHQ15669 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RHOHQ15669 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
RHOHQ15669 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
RHOHQ15669 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
RHOHQ15669 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
RHOHQ15669 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
RHOHQ15669 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
RHOHQ15669 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
RHOHQ15669 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
RHOHQ15669 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
RHOHQ15669 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
RHOHQ15669 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
RHOHQ15669 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
RHOHQ15669 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
RHOHQ15669 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
RHOHQ15669 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
RHOHQ15669 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
RHOHQ15669 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
RHOHQ15669 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
RHOHQ15669 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
RHOHQ15669 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
RHOHQ15669 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
RHOHQ15669 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
RHOHQ15669 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
RHOHQ15669 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RHOHQ15669 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RHOHQ15669 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RHOHQ15669 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
RHOHQ15669 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
RHOHQ15669 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RHOHQ15669 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
RHOHQ15669 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
RHOHQ15669 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
RHOHQ15669 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RHOHQ15669 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RHOHQ15669 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
RHOHQ15669 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RHOHQ15669 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RHOHQ15669 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RHOHQ15669 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RHOHQ15669 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RHOHQ15669 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RHOHQ15669 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RHOHQ15669 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RHOHQ15669 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RHOHQ15669 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RHOHQ15669 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RHOHQ15669 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RHOHQ15669 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RHOHQ15669 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RHOHQ15669 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
RHOHQ15669 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 127 ms