Protein–RNA interactions for Protein: Q15651

HMGN3, High mobility group nucleosome-binding domain-containing protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGN3Q15651 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HMGN3Q15651 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HMGN3Q15651 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HMGN3Q15651 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HMGN3Q15651 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HMGN3Q15651 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HMGN3Q15651 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HMGN3Q15651 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HMGN3Q15651 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HMGN3Q15651 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
HMGN3Q15651 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HMGN3Q15651 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HMGN3Q15651 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
HMGN3Q15651 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HMGN3Q15651 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HMGN3Q15651 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HMGN3Q15651 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HMGN3Q15651 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HMGN3Q15651 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HMGN3Q15651 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HMGN3Q15651 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HMGN3Q15651 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HMGN3Q15651 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HMGN3Q15651 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
HMGN3Q15651 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
HMGN3Q15651 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HMGN3Q15651 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HMGN3Q15651 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HMGN3Q15651 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HMGN3Q15651 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HMGN3Q15651 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HMGN3Q15651 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HMGN3Q15651 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HMGN3Q15651 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HMGN3Q15651 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HMGN3Q15651 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HMGN3Q15651 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HMGN3Q15651 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HMGN3Q15651 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HMGN3Q15651 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HMGN3Q15651 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HMGN3Q15651 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HMGN3Q15651 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HMGN3Q15651 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HMGN3Q15651 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HMGN3Q15651 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HMGN3Q15651 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HMGN3Q15651 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HMGN3Q15651 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HMGN3Q15651 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HMGN3Q15651 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HMGN3Q15651 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HMGN3Q15651 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HMGN3Q15651 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HMGN3Q15651 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
HMGN3Q15651 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HMGN3Q15651 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HMGN3Q15651 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HMGN3Q15651 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HMGN3Q15651 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HMGN3Q15651 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HMGN3Q15651 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HMGN3Q15651 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HMGN3Q15651 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HMGN3Q15651 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HMGN3Q15651 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HMGN3Q15651 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HMGN3Q15651 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HMGN3Q15651 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HMGN3Q15651 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
HMGN3Q15651 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
HMGN3Q15651 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
HMGN3Q15651 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HMGN3Q15651 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HMGN3Q15651 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HMGN3Q15651 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HMGN3Q15651 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HMGN3Q15651 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HMGN3Q15651 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HMGN3Q15651 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HMGN3Q15651 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HMGN3Q15651 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HMGN3Q15651 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HMGN3Q15651 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HMGN3Q15651 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HMGN3Q15651 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HMGN3Q15651 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HMGN3Q15651 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HMGN3Q15651 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HMGN3Q15651 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HMGN3Q15651 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HMGN3Q15651 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HMGN3Q15651 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HMGN3Q15651 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HMGN3Q15651 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
HMGN3Q15651 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HMGN3Q15651 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HMGN3Q15651 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HMGN3Q15651 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HMGN3Q15651 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
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