Protein–RNA interactions for Protein: Q15651

HMGN3, High mobility group nucleosome-binding domain-containing protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGN3Q15651 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
HMGN3Q15651 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
HMGN3Q15651 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC27.85■■■□□ 2.05
HMGN3Q15651 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC27.56■■■□□ 2
HMGN3Q15651 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
HMGN3Q15651 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
HMGN3Q15651 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
HMGN3Q15651 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
HMGN3Q15651 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
HMGN3Q15651 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
HMGN3Q15651 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
HMGN3Q15651 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
HMGN3Q15651 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
HMGN3Q15651 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
HMGN3Q15651 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
HMGN3Q15651 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
HMGN3Q15651 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
HMGN3Q15651 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
HMGN3Q15651 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
HMGN3Q15651 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
HMGN3Q15651 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
HMGN3Q15651 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
HMGN3Q15651 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
HMGN3Q15651 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
HMGN3Q15651 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
HMGN3Q15651 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
HMGN3Q15651 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
HMGN3Q15651 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
HMGN3Q15651 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
HMGN3Q15651 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
HMGN3Q15651 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
HMGN3Q15651 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
HMGN3Q15651 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
HMGN3Q15651 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
HMGN3Q15651 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
HMGN3Q15651 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
HMGN3Q15651 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
HMGN3Q15651 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
HMGN3Q15651 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
HMGN3Q15651 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
HMGN3Q15651 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
HMGN3Q15651 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
HMGN3Q15651 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
HMGN3Q15651 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
HMGN3Q15651 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
HMGN3Q15651 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
HMGN3Q15651 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
HMGN3Q15651 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
HMGN3Q15651 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
HMGN3Q15651 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
HMGN3Q15651 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
HMGN3Q15651 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
HMGN3Q15651 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
HMGN3Q15651 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
HMGN3Q15651 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
HMGN3Q15651 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
HMGN3Q15651 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
HMGN3Q15651 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
HMGN3Q15651 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
HMGN3Q15651 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
HMGN3Q15651 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
HMGN3Q15651 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
HMGN3Q15651 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
HMGN3Q15651 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
HMGN3Q15651 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
HMGN3Q15651 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HMGN3Q15651 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
HMGN3Q15651 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
HMGN3Q15651 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
HMGN3Q15651 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
HMGN3Q15651 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
HMGN3Q15651 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
HMGN3Q15651 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
HMGN3Q15651 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
HMGN3Q15651 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
HMGN3Q15651 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HMGN3Q15651 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
HMGN3Q15651 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HMGN3Q15651 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
HMGN3Q15651 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HMGN3Q15651 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
HMGN3Q15651 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
HMGN3Q15651 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
HMGN3Q15651 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HMGN3Q15651 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
HMGN3Q15651 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
HMGN3Q15651 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
HMGN3Q15651 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HMGN3Q15651 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HMGN3Q15651 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
HMGN3Q15651 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
HMGN3Q15651 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
HMGN3Q15651 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HMGN3Q15651 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HMGN3Q15651 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HMGN3Q15651 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HMGN3Q15651 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
HMGN3Q15651 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
HMGN3Q15651 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
HMGN3Q15651 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
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