Protein–RNA interactions for Protein: Q14162

SCARF1, Scavenger receptor class F member 1, humanhuman

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Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARF1Q14162 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
SCARF1Q14162 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.57■■■□□ 2.96
SCARF1Q14162 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC33.57■■■□□ 2.96
SCARF1Q14162 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.56■■■□□ 2.96
SCARF1Q14162 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
SCARF1Q14162 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
SCARF1Q14162 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
SCARF1Q14162 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
SCARF1Q14162 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC33.53■■■□□ 2.96
SCARF1Q14162 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC33.52■■■□□ 2.96
SCARF1Q14162 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC33.51■■■□□ 2.95
SCARF1Q14162 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC33.51■■■□□ 2.95
SCARF1Q14162 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC33.5■■■□□ 2.95
SCARF1Q14162 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC33.48■■■□□ 2.95
SCARF1Q14162 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC33.48■■■□□ 2.95
SCARF1Q14162 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
SCARF1Q14162 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC33.47■■■□□ 2.95
SCARF1Q14162 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
SCARF1Q14162 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC33.46■■■□□ 2.95
SCARF1Q14162 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
SCARF1Q14162 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.45■■■□□ 2.95
SCARF1Q14162 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
SCARF1Q14162 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC33.42■■■□□ 2.94
SCARF1Q14162 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
SCARF1Q14162 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
SCARF1Q14162 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC33.41■■■□□ 2.94
SCARF1Q14162 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC33.41■■■□□ 2.94
SCARF1Q14162 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC33.4■■■□□ 2.94
SCARF1Q14162 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
SCARF1Q14162 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
SCARF1Q14162 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC33.38■■■□□ 2.93
SCARF1Q14162 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
SCARF1Q14162 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
SCARF1Q14162 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC33.37■■■□□ 2.93
SCARF1Q14162 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
SCARF1Q14162 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
SCARF1Q14162 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC33.34■■■□□ 2.93
SCARF1Q14162 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC33.33■■■□□ 2.93
SCARF1Q14162 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
SCARF1Q14162 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC33.32■■■□□ 2.92
SCARF1Q14162 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
SCARF1Q14162 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.31■■■□□ 2.92
SCARF1Q14162 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.31■■■□□ 2.92
SCARF1Q14162 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC33.31■■■□□ 2.92
SCARF1Q14162 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC33.31■■■□□ 2.92
SCARF1Q14162 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
SCARF1Q14162 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC33.3■■■□□ 2.92
SCARF1Q14162 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
SCARF1Q14162 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
SCARF1Q14162 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
SCARF1Q14162 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC33.29■■■□□ 2.92
SCARF1Q14162 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC33.28■■■□□ 2.92
SCARF1Q14162 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
SCARF1Q14162 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
SCARF1Q14162 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.26■■■□□ 2.91
SCARF1Q14162 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC33.25■■■□□ 2.91
SCARF1Q14162 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
SCARF1Q14162 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
SCARF1Q14162 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
SCARF1Q14162 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
SCARF1Q14162 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.18■■■□□ 2.9
SCARF1Q14162 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
SCARF1Q14162 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC33.17■■■□□ 2.9
SCARF1Q14162 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC33.16■■■□□ 2.9
SCARF1Q14162 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC33.16■■■□□ 2.9
SCARF1Q14162 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC33.16■■■□□ 2.9
SCARF1Q14162 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC33.16■■■□□ 2.9
SCARF1Q14162 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
SCARF1Q14162 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC33.15■■■□□ 2.9
SCARF1Q14162 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
SCARF1Q14162 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC33.13■■■□□ 2.89
SCARF1Q14162 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC33.13■■■□□ 2.89
SCARF1Q14162 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC33.13■■■□□ 2.89
SCARF1Q14162 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC33.12■■■□□ 2.89
SCARF1Q14162 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.12■■■□□ 2.89
SCARF1Q14162 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
SCARF1Q14162 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
SCARF1Q14162 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
SCARF1Q14162 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
SCARF1Q14162 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC33.1■■■□□ 2.89
SCARF1Q14162 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
SCARF1Q14162 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
SCARF1Q14162 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
SCARF1Q14162 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
SCARF1Q14162 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC33.05■■■□□ 2.88
SCARF1Q14162 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
SCARF1Q14162 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC33.05■■■□□ 2.88
SCARF1Q14162 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC33.05■■■□□ 2.88
SCARF1Q14162 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC33.04■■■□□ 2.88
SCARF1Q14162 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
SCARF1Q14162 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
SCARF1Q14162 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.88
SCARF1Q14162 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC33.01■■■□□ 2.88
SCARF1Q14162 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC33.01■■■□□ 2.87
SCARF1Q14162 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC33■■■□□ 2.87
SCARF1Q14162 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
SCARF1Q14162 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
SCARF1Q14162 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
SCARF1Q14162 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
SCARF1Q14162 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
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