Protein–RNA interactions for Protein: Q02548

PAX5, Paired box protein Pax-5, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAX5Q02548 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PAX5Q02548 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PAX5Q02548 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PAX5Q02548 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PAX5Q02548 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PAX5Q02548 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PAX5Q02548 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PAX5Q02548 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PAX5Q02548 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PAX5Q02548 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PAX5Q02548 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PAX5Q02548 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PAX5Q02548 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PAX5Q02548 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PAX5Q02548 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PAX5Q02548 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PAX5Q02548 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PAX5Q02548 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PAX5Q02548 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PAX5Q02548 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PAX5Q02548 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PAX5Q02548 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PAX5Q02548 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PAX5Q02548 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PAX5Q02548 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PAX5Q02548 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PAX5Q02548 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PAX5Q02548 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PAX5Q02548 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PAX5Q02548 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PAX5Q02548 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PAX5Q02548 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PAX5Q02548 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PAX5Q02548 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PAX5Q02548 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PAX5Q02548 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PAX5Q02548 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PAX5Q02548 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PAX5Q02548 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PAX5Q02548 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PAX5Q02548 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PAX5Q02548 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
PAX5Q02548 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PAX5Q02548 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PAX5Q02548 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PAX5Q02548 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PAX5Q02548 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PAX5Q02548 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PAX5Q02548 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PAX5Q02548 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
PAX5Q02548 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PAX5Q02548 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PAX5Q02548 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PAX5Q02548 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PAX5Q02548 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
PAX5Q02548 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PAX5Q02548 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PAX5Q02548 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PAX5Q02548 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PAX5Q02548 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PAX5Q02548 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PAX5Q02548 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PAX5Q02548 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PAX5Q02548 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PAX5Q02548 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PAX5Q02548 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PAX5Q02548 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PAX5Q02548 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PAX5Q02548 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PAX5Q02548 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PAX5Q02548 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
PAX5Q02548 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PAX5Q02548 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PAX5Q02548 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PAX5Q02548 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PAX5Q02548 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PAX5Q02548 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PAX5Q02548 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PAX5Q02548 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PAX5Q02548 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PAX5Q02548 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PAX5Q02548 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PAX5Q02548 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PAX5Q02548 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PAX5Q02548 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PAX5Q02548 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PAX5Q02548 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
PAX5Q02548 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PAX5Q02548 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PAX5Q02548 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PAX5Q02548 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PAX5Q02548 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PAX5Q02548 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PAX5Q02548 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PAX5Q02548 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PAX5Q02548 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PAX5Q02548 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PAX5Q02548 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PAX5Q02548 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PAX5Q02548 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.3 ms