Protein–RNA interactions for Protein: Q02548

PAX5, Paired box protein Pax-5, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAX5Q02548 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PAX5Q02548 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC28.13■■■□□ 2.09
PAX5Q02548 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
PAX5Q02548 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
PAX5Q02548 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PAX5Q02548 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PAX5Q02548 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PAX5Q02548 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PAX5Q02548 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PAX5Q02548 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PAX5Q02548 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PAX5Q02548 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PAX5Q02548 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PAX5Q02548 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PAX5Q02548 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PAX5Q02548 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PAX5Q02548 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PAX5Q02548 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PAX5Q02548 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PAX5Q02548 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PAX5Q02548 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PAX5Q02548 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PAX5Q02548 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PAX5Q02548 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PAX5Q02548 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PAX5Q02548 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PAX5Q02548 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PAX5Q02548 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PAX5Q02548 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PAX5Q02548 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PAX5Q02548 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PAX5Q02548 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PAX5Q02548 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
PAX5Q02548 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PAX5Q02548 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PAX5Q02548 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PAX5Q02548 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PAX5Q02548 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PAX5Q02548 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PAX5Q02548 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PAX5Q02548 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PAX5Q02548 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PAX5Q02548 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PAX5Q02548 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PAX5Q02548 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PAX5Q02548 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PAX5Q02548 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PAX5Q02548 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PAX5Q02548 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PAX5Q02548 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PAX5Q02548 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
PAX5Q02548 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PAX5Q02548 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PAX5Q02548 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PAX5Q02548 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PAX5Q02548 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PAX5Q02548 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PAX5Q02548 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PAX5Q02548 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PAX5Q02548 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PAX5Q02548 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PAX5Q02548 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PAX5Q02548 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PAX5Q02548 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PAX5Q02548 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PAX5Q02548 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PAX5Q02548 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PAX5Q02548 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PAX5Q02548 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PAX5Q02548 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PAX5Q02548 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PAX5Q02548 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PAX5Q02548 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
PAX5Q02548 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PAX5Q02548 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PAX5Q02548 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PAX5Q02548 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PAX5Q02548 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PAX5Q02548 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PAX5Q02548 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PAX5Q02548 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PAX5Q02548 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PAX5Q02548 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PAX5Q02548 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PAX5Q02548 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PAX5Q02548 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
PAX5Q02548 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PAX5Q02548 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PAX5Q02548 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PAX5Q02548 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PAX5Q02548 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PAX5Q02548 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PAX5Q02548 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PAX5Q02548 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PAX5Q02548 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PAX5Q02548 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PAX5Q02548 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PAX5Q02548 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PAX5Q02548 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PAX5Q02548 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms