Protein–RNA interactions for Protein: P80303

NUCB2, Nucleobindin-2, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUCB2P80303 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.89■■■□□ 2.7
NUCB2P80303 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.88■■■□□ 2.69
NUCB2P80303 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC31.87■■■□□ 2.69
NUCB2P80303 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
NUCB2P80303 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
NUCB2P80303 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC31.83■■■□□ 2.69
NUCB2P80303 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC31.83■■■□□ 2.69
NUCB2P80303 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
NUCB2P80303 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
NUCB2P80303 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
NUCB2P80303 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC31.8■■■□□ 2.68
NUCB2P80303 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC31.8■■■□□ 2.68
NUCB2P80303 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
NUCB2P80303 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
NUCB2P80303 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.68
NUCB2P80303 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
NUCB2P80303 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
NUCB2P80303 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
NUCB2P80303 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
NUCB2P80303 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
NUCB2P80303 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.73■■■□□ 2.67
NUCB2P80303 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
NUCB2P80303 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
NUCB2P80303 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC31.72■■■□□ 2.67
NUCB2P80303 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
NUCB2P80303 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
NUCB2P80303 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
NUCB2P80303 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
NUCB2P80303 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
NUCB2P80303 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.68■■■□□ 2.66
NUCB2P80303 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
NUCB2P80303 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC31.67■■■□□ 2.66
NUCB2P80303 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC31.67■■■□□ 2.66
NUCB2P80303 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC31.66■■■□□ 2.66
NUCB2P80303 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC31.66■■■□□ 2.66
NUCB2P80303 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
NUCB2P80303 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
NUCB2P80303 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
NUCB2P80303 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
NUCB2P80303 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC31.6■■■□□ 2.65
NUCB2P80303 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
NUCB2P80303 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
NUCB2P80303 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC31.58■■■□□ 2.65
NUCB2P80303 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC31.57■■■□□ 2.64
NUCB2P80303 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC31.56■■■□□ 2.64
NUCB2P80303 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
NUCB2P80303 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
NUCB2P80303 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
NUCB2P80303 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
NUCB2P80303 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.54■■■□□ 2.64
NUCB2P80303 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.54■■■□□ 2.64
NUCB2P80303 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
NUCB2P80303 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
NUCB2P80303 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC31.53■■■□□ 2.64
NUCB2P80303 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
NUCB2P80303 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC31.51■■■□□ 2.63
NUCB2P80303 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
NUCB2P80303 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC31.5■■■□□ 2.63
NUCB2P80303 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
NUCB2P80303 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
NUCB2P80303 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.49■■■□□ 2.63
NUCB2P80303 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
NUCB2P80303 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
NUCB2P80303 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
NUCB2P80303 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC31.45■■■□□ 2.63
NUCB2P80303 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.62
NUCB2P80303 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC31.45■■■□□ 2.62
NUCB2P80303 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.44■■■□□ 2.62
NUCB2P80303 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
NUCB2P80303 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC31.44■■■□□ 2.62
NUCB2P80303 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.43■■■□□ 2.62
NUCB2P80303 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC31.42■■■□□ 2.62
NUCB2P80303 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC31.42■■■□□ 2.62
NUCB2P80303 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
NUCB2P80303 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC31.41■■■□□ 2.62
NUCB2P80303 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
NUCB2P80303 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
NUCB2P80303 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
NUCB2P80303 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
NUCB2P80303 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
NUCB2P80303 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
NUCB2P80303 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
NUCB2P80303 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
NUCB2P80303 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
NUCB2P80303 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.34■■■□□ 2.61
NUCB2P80303 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
NUCB2P80303 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
NUCB2P80303 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC31.31■■■□□ 2.6
NUCB2P80303 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
NUCB2P80303 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
NUCB2P80303 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
NUCB2P80303 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.29■■■□□ 2.6
NUCB2P80303 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC31.29■■■□□ 2.6
NUCB2P80303 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
NUCB2P80303 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.28■■■□□ 2.6
NUCB2P80303 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
NUCB2P80303 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
NUCB2P80303 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
NUCB2P80303 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC31.28■■■□□ 2.6
NUCB2P80303 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms