Protein–RNA interactions for Protein: P62316

SNRPD2, Small nuclear ribonucleoprotein Sm D2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRPD2P62316 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SNRPD2P62316 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SNRPD2P62316 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SNRPD2P62316 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SNRPD2P62316 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SNRPD2P62316 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SNRPD2P62316 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SNRPD2P62316 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SNRPD2P62316 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SNRPD2P62316 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SNRPD2P62316 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
SNRPD2P62316 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
SNRPD2P62316 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
SNRPD2P62316 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SNRPD2P62316 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SNRPD2P62316 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SNRPD2P62316 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SNRPD2P62316 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
SNRPD2P62316 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SNRPD2P62316 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SNRPD2P62316 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SNRPD2P62316 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SNRPD2P62316 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SNRPD2P62316 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SNRPD2P62316 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SNRPD2P62316 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SNRPD2P62316 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SNRPD2P62316 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SNRPD2P62316 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SNRPD2P62316 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SNRPD2P62316 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SNRPD2P62316 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SNRPD2P62316 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SNRPD2P62316 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SNRPD2P62316 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SNRPD2P62316 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SNRPD2P62316 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SNRPD2P62316 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SNRPD2P62316 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SNRPD2P62316 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SNRPD2P62316 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SNRPD2P62316 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SNRPD2P62316 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SNRPD2P62316 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SNRPD2P62316 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SNRPD2P62316 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SNRPD2P62316 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SNRPD2P62316 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SNRPD2P62316 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SNRPD2P62316 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SNRPD2P62316 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SNRPD2P62316 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
SNRPD2P62316 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SNRPD2P62316 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
SNRPD2P62316 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SNRPD2P62316 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SNRPD2P62316 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SNRPD2P62316 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SNRPD2P62316 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SNRPD2P62316 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SNRPD2P62316 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SNRPD2P62316 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SNRPD2P62316 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SNRPD2P62316 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SNRPD2P62316 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SNRPD2P62316 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SNRPD2P62316 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SNRPD2P62316 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SNRPD2P62316 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SNRPD2P62316 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SNRPD2P62316 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SNRPD2P62316 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SNRPD2P62316 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SNRPD2P62316 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SNRPD2P62316 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SNRPD2P62316 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SNRPD2P62316 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SNRPD2P62316 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SNRPD2P62316 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SNRPD2P62316 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SNRPD2P62316 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SNRPD2P62316 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SNRPD2P62316 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SNRPD2P62316 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
SNRPD2P62316 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
SNRPD2P62316 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SNRPD2P62316 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SNRPD2P62316 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SNRPD2P62316 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SNRPD2P62316 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SNRPD2P62316 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SNRPD2P62316 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SNRPD2P62316 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SNRPD2P62316 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SNRPD2P62316 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SNRPD2P62316 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SNRPD2P62316 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SNRPD2P62316 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SNRPD2P62316 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SNRPD2P62316 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.6 ms