Protein–RNA interactions for Protein: P59091

LINC00315, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00315, humanhuman

Predictions only

Length 139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00315P59091 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
LINC00315P59091 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
LINC00315P59091 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
LINC00315P59091 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
LINC00315P59091 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
LINC00315P59091 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
LINC00315P59091 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
LINC00315P59091 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
LINC00315P59091 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
LINC00315P59091 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
LINC00315P59091 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
LINC00315P59091 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
LINC00315P59091 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
LINC00315P59091 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
LINC00315P59091 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
LINC00315P59091 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
LINC00315P59091 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
LINC00315P59091 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
LINC00315P59091 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
LINC00315P59091 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
LINC00315P59091 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
LINC00315P59091 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
LINC00315P59091 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
LINC00315P59091 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
LINC00315P59091 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
LINC00315P59091 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
LINC00315P59091 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
LINC00315P59091 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
LINC00315P59091 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
LINC00315P59091 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
LINC00315P59091 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
LINC00315P59091 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
LINC00315P59091 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
LINC00315P59091 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
LINC00315P59091 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
LINC00315P59091 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
LINC00315P59091 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
LINC00315P59091 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
LINC00315P59091 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
LINC00315P59091 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
LINC00315P59091 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
LINC00315P59091 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
LINC00315P59091 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
LINC00315P59091 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
LINC00315P59091 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
LINC00315P59091 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
LINC00315P59091 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
LINC00315P59091 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
LINC00315P59091 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
LINC00315P59091 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
LINC00315P59091 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
LINC00315P59091 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
LINC00315P59091 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
LINC00315P59091 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
LINC00315P59091 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
LINC00315P59091 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
LINC00315P59091 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
LINC00315P59091 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
LINC00315P59091 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
LINC00315P59091 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
LINC00315P59091 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.42■□□□□ 0.7
LINC00315P59091 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
LINC00315P59091 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
LINC00315P59091 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
LINC00315P59091 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
LINC00315P59091 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
LINC00315P59091 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC19.4■□□□□ 0.7
LINC00315P59091 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
LINC00315P59091 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
LINC00315P59091 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
LINC00315P59091 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
LINC00315P59091 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
LINC00315P59091 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
LINC00315P59091 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
LINC00315P59091 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
LINC00315P59091 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
LINC00315P59091 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
LINC00315P59091 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
LINC00315P59091 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
LINC00315P59091 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
LINC00315P59091 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
LINC00315P59091 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
LINC00315P59091 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
LINC00315P59091 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
LINC00315P59091 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
LINC00315P59091 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
LINC00315P59091 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
LINC00315P59091 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
LINC00315P59091 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
LINC00315P59091 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
LINC00315P59091 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
LINC00315P59091 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
LINC00315P59091 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
LINC00315P59091 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
LINC00315P59091 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
LINC00315P59091 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
LINC00315P59091 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
LINC00315P59091 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
LINC00315P59091 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
LINC00315P59091 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 340.5 ms