Protein–RNA interactions for Protein: P59089

LINC00205, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00205, humanhuman

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00205P59089 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LINC00205P59089 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LINC00205P59089 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LINC00205P59089 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LINC00205P59089 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LINC00205P59089 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LINC00205P59089 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LINC00205P59089 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LINC00205P59089 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LINC00205P59089 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LINC00205P59089 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LINC00205P59089 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LINC00205P59089 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LINC00205P59089 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
LINC00205P59089 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LINC00205P59089 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LINC00205P59089 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LINC00205P59089 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LINC00205P59089 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LINC00205P59089 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LINC00205P59089 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LINC00205P59089 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LINC00205P59089 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LINC00205P59089 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LINC00205P59089 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LINC00205P59089 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LINC00205P59089 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LINC00205P59089 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
LINC00205P59089 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LINC00205P59089 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LINC00205P59089 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LINC00205P59089 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LINC00205P59089 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LINC00205P59089 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LINC00205P59089 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LINC00205P59089 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
LINC00205P59089 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LINC00205P59089 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LINC00205P59089 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LINC00205P59089 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LINC00205P59089 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LINC00205P59089 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LINC00205P59089 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LINC00205P59089 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LINC00205P59089 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LINC00205P59089 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LINC00205P59089 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LINC00205P59089 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LINC00205P59089 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LINC00205P59089 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
LINC00205P59089 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LINC00205P59089 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LINC00205P59089 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LINC00205P59089 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LINC00205P59089 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
LINC00205P59089 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
LINC00205P59089 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LINC00205P59089 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
LINC00205P59089 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LINC00205P59089 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
LINC00205P59089 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
LINC00205P59089 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LINC00205P59089 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LINC00205P59089 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LINC00205P59089 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LINC00205P59089 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
LINC00205P59089 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LINC00205P59089 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
LINC00205P59089 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
LINC00205P59089 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
LINC00205P59089 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
LINC00205P59089 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LINC00205P59089 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LINC00205P59089 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
LINC00205P59089 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LINC00205P59089 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
LINC00205P59089 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LINC00205P59089 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LINC00205P59089 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LINC00205P59089 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LINC00205P59089 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
LINC00205P59089 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
LINC00205P59089 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
LINC00205P59089 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
LINC00205P59089 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
LINC00205P59089 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
LINC00205P59089 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LINC00205P59089 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LINC00205P59089 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LINC00205P59089 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LINC00205P59089 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LINC00205P59089 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LINC00205P59089 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LINC00205P59089 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
LINC00205P59089 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LINC00205P59089 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LINC00205P59089 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LINC00205P59089 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
LINC00205P59089 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LINC00205P59089 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.8 ms