Protein–RNA interactions for Protein: P48995

TRPC1, Short transient receptor potential channel 1, humanhuman

Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPC1P48995 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TRPC1P48995 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TRPC1P48995 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TRPC1P48995 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TRPC1P48995 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TRPC1P48995 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
TRPC1P48995 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TRPC1P48995 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TRPC1P48995 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TRPC1P48995 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TRPC1P48995 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TRPC1P48995 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TRPC1P48995 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TRPC1P48995 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TRPC1P48995 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TRPC1P48995 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TRPC1P48995 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
TRPC1P48995 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TRPC1P48995 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TRPC1P48995 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TRPC1P48995 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TRPC1P48995 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
TRPC1P48995 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TRPC1P48995 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TRPC1P48995 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TRPC1P48995 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TRPC1P48995 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TRPC1P48995 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TRPC1P48995 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
TRPC1P48995 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TRPC1P48995 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TRPC1P48995 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TRPC1P48995 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TRPC1P48995 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TRPC1P48995 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TRPC1P48995 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TRPC1P48995 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TRPC1P48995 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TRPC1P48995 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TRPC1P48995 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TRPC1P48995 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TRPC1P48995 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TRPC1P48995 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TRPC1P48995 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TRPC1P48995 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
TRPC1P48995 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TRPC1P48995 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TRPC1P48995 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TRPC1P48995 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TRPC1P48995 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TRPC1P48995 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TRPC1P48995 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TRPC1P48995 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
TRPC1P48995 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TRPC1P48995 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TRPC1P48995 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TRPC1P48995 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TRPC1P48995 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TRPC1P48995 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TRPC1P48995 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TRPC1P48995 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TRPC1P48995 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TRPC1P48995 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TRPC1P48995 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TRPC1P48995 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TRPC1P48995 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TRPC1P48995 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TRPC1P48995 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TRPC1P48995 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
TRPC1P48995 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TRPC1P48995 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TRPC1P48995 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TRPC1P48995 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TRPC1P48995 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TRPC1P48995 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TRPC1P48995 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TRPC1P48995 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TRPC1P48995 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TRPC1P48995 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TRPC1P48995 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TRPC1P48995 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TRPC1P48995 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TRPC1P48995 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TRPC1P48995 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TRPC1P48995 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TRPC1P48995 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TRPC1P48995 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TRPC1P48995 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TRPC1P48995 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TRPC1P48995 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TRPC1P48995 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TRPC1P48995 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
TRPC1P48995 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TRPC1P48995 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TRPC1P48995 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TRPC1P48995 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TRPC1P48995 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TRPC1P48995 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TRPC1P48995 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TRPC1P48995 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms