Protein–RNA interactions for Protein: P25103

TACR1, Substance-P receptor, humanhuman

Predictions only

Length 407 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TACR1P25103 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TACR1P25103 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TACR1P25103 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TACR1P25103 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TACR1P25103 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TACR1P25103 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TACR1P25103 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TACR1P25103 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
TACR1P25103 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TACR1P25103 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TACR1P25103 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TACR1P25103 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TACR1P25103 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
TACR1P25103 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TACR1P25103 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TACR1P25103 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TACR1P25103 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TACR1P25103 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TACR1P25103 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TACR1P25103 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
TACR1P25103 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TACR1P25103 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TACR1P25103 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TACR1P25103 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TACR1P25103 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TACR1P25103 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TACR1P25103 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TACR1P25103 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TACR1P25103 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TACR1P25103 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TACR1P25103 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
TACR1P25103 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TACR1P25103 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TACR1P25103 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TACR1P25103 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TACR1P25103 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TACR1P25103 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TACR1P25103 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TACR1P25103 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TACR1P25103 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TACR1P25103 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TACR1P25103 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TACR1P25103 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TACR1P25103 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TACR1P25103 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TACR1P25103 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TACR1P25103 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TACR1P25103 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TACR1P25103 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
TACR1P25103 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TACR1P25103 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TACR1P25103 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TACR1P25103 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TACR1P25103 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TACR1P25103 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TACR1P25103 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TACR1P25103 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TACR1P25103 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TACR1P25103 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TACR1P25103 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TACR1P25103 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TACR1P25103 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TACR1P25103 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TACR1P25103 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TACR1P25103 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TACR1P25103 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
TACR1P25103 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
TACR1P25103 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
TACR1P25103 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TACR1P25103 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
TACR1P25103 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TACR1P25103 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TACR1P25103 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TACR1P25103 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TACR1P25103 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TACR1P25103 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TACR1P25103 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TACR1P25103 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TACR1P25103 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TACR1P25103 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
TACR1P25103 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TACR1P25103 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TACR1P25103 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TACR1P25103 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TACR1P25103 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TACR1P25103 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TACR1P25103 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TACR1P25103 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TACR1P25103 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TACR1P25103 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
TACR1P25103 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TACR1P25103 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TACR1P25103 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TACR1P25103 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
TACR1P25103 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TACR1P25103 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TACR1P25103 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TACR1P25103 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TACR1P25103 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TACR1P25103 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms