Protein–RNA interactions for Protein: P20336

RAB3A, Ras-related protein Rab-3A, humanhuman

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB3AP20336 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RAB3AP20336 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RAB3AP20336 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RAB3AP20336 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RAB3AP20336 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RAB3AP20336 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RAB3AP20336 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RAB3AP20336 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RAB3AP20336 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RAB3AP20336 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RAB3AP20336 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RAB3AP20336 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RAB3AP20336 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RAB3AP20336 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RAB3AP20336 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RAB3AP20336 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
RAB3AP20336 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RAB3AP20336 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RAB3AP20336 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RAB3AP20336 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RAB3AP20336 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RAB3AP20336 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RAB3AP20336 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RAB3AP20336 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RAB3AP20336 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RAB3AP20336 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RAB3AP20336 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
RAB3AP20336 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RAB3AP20336 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RAB3AP20336 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RAB3AP20336 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RAB3AP20336 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RAB3AP20336 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RAB3AP20336 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RAB3AP20336 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RAB3AP20336 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RAB3AP20336 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RAB3AP20336 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
RAB3AP20336 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RAB3AP20336 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RAB3AP20336 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RAB3AP20336 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RAB3AP20336 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RAB3AP20336 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RAB3AP20336 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RAB3AP20336 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RAB3AP20336 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RAB3AP20336 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RAB3AP20336 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RAB3AP20336 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RAB3AP20336 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RAB3AP20336 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RAB3AP20336 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RAB3AP20336 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RAB3AP20336 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
RAB3AP20336 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RAB3AP20336 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RAB3AP20336 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RAB3AP20336 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RAB3AP20336 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RAB3AP20336 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RAB3AP20336 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RAB3AP20336 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RAB3AP20336 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RAB3AP20336 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RAB3AP20336 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
RAB3AP20336 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RAB3AP20336 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RAB3AP20336 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RAB3AP20336 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RAB3AP20336 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RAB3AP20336 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RAB3AP20336 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RAB3AP20336 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RAB3AP20336 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RAB3AP20336 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RAB3AP20336 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RAB3AP20336 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RAB3AP20336 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RAB3AP20336 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RAB3AP20336 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RAB3AP20336 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RAB3AP20336 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RAB3AP20336 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RAB3AP20336 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RAB3AP20336 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RAB3AP20336 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RAB3AP20336 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RAB3AP20336 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RAB3AP20336 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
RAB3AP20336 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RAB3AP20336 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
RAB3AP20336 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RAB3AP20336 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RAB3AP20336 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RAB3AP20336 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RAB3AP20336 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RAB3AP20336 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RAB3AP20336 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RAB3AP20336 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms