Protein–RNA interactions for Protein: P19474

TRIM21, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM21, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM21P19474 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
TRIM21P19474 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
TRIM21P19474 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
TRIM21P19474 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
TRIM21P19474 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
TRIM21P19474 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
TRIM21P19474 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
TRIM21P19474 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC29.76■■■□□ 2.35
TRIM21P19474 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
TRIM21P19474 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
TRIM21P19474 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
TRIM21P19474 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
TRIM21P19474 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
TRIM21P19474 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
TRIM21P19474 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
TRIM21P19474 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC29.7■■■□□ 2.34
TRIM21P19474 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
TRIM21P19474 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
TRIM21P19474 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
TRIM21P19474 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
TRIM21P19474 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC29.66■■■□□ 2.34
TRIM21P19474 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
TRIM21P19474 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
TRIM21P19474 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
TRIM21P19474 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
TRIM21P19474 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
TRIM21P19474 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
TRIM21P19474 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
TRIM21P19474 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
TRIM21P19474 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
TRIM21P19474 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
TRIM21P19474 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
TRIM21P19474 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
TRIM21P19474 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
TRIM21P19474 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
TRIM21P19474 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC29.54■■■□□ 2.32
TRIM21P19474 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC29.53■■■□□ 2.32
TRIM21P19474 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
TRIM21P19474 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
TRIM21P19474 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
TRIM21P19474 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
TRIM21P19474 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
TRIM21P19474 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
TRIM21P19474 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
TRIM21P19474 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
TRIM21P19474 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
TRIM21P19474 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
TRIM21P19474 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
TRIM21P19474 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
TRIM21P19474 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
TRIM21P19474 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
TRIM21P19474 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
TRIM21P19474 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
TRIM21P19474 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
TRIM21P19474 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
TRIM21P19474 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
TRIM21P19474 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
TRIM21P19474 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC29.4■■■□□ 2.3
TRIM21P19474 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
TRIM21P19474 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
TRIM21P19474 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
TRIM21P19474 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
TRIM21P19474 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
TRIM21P19474 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
TRIM21P19474 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
TRIM21P19474 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
TRIM21P19474 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
TRIM21P19474 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
TRIM21P19474 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
TRIM21P19474 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
TRIM21P19474 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
TRIM21P19474 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
TRIM21P19474 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
TRIM21P19474 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
TRIM21P19474 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC29.35■■■□□ 2.29
TRIM21P19474 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
TRIM21P19474 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
TRIM21P19474 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
TRIM21P19474 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
TRIM21P19474 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
TRIM21P19474 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC29.32■■■□□ 2.28
TRIM21P19474 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
TRIM21P19474 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
TRIM21P19474 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
TRIM21P19474 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
TRIM21P19474 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
TRIM21P19474 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
TRIM21P19474 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
TRIM21P19474 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
TRIM21P19474 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
TRIM21P19474 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
TRIM21P19474 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
TRIM21P19474 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
TRIM21P19474 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
TRIM21P19474 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
TRIM21P19474 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
TRIM21P19474 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
TRIM21P19474 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
TRIM21P19474 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
TRIM21P19474 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 165.5 ms