Protein–RNA interactions for Protein: P15976

GATA1, Erythroid transcription factor, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GATA1P15976 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
GATA1P15976 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
GATA1P15976 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
GATA1P15976 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
GATA1P15976 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
GATA1P15976 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
GATA1P15976 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
GATA1P15976 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
GATA1P15976 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
GATA1P15976 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
GATA1P15976 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
GATA1P15976 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
GATA1P15976 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
GATA1P15976 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.75
GATA1P15976 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
GATA1P15976 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
GATA1P15976 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
GATA1P15976 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
GATA1P15976 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
GATA1P15976 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
GATA1P15976 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
GATA1P15976 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
GATA1P15976 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
GATA1P15976 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
GATA1P15976 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
GATA1P15976 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
GATA1P15976 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
GATA1P15976 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
GATA1P15976 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
GATA1P15976 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
GATA1P15976 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
GATA1P15976 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
GATA1P15976 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
GATA1P15976 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
GATA1P15976 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
GATA1P15976 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
GATA1P15976 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
GATA1P15976 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
GATA1P15976 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
GATA1P15976 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
GATA1P15976 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
GATA1P15976 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
GATA1P15976 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
GATA1P15976 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
GATA1P15976 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
GATA1P15976 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
GATA1P15976 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
GATA1P15976 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
GATA1P15976 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
GATA1P15976 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
GATA1P15976 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.74
GATA1P15976 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
GATA1P15976 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
GATA1P15976 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
GATA1P15976 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
GATA1P15976 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
GATA1P15976 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC19.62■□□□□ 0.73
GATA1P15976 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
GATA1P15976 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
GATA1P15976 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
GATA1P15976 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
GATA1P15976 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
GATA1P15976 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
GATA1P15976 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
GATA1P15976 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
GATA1P15976 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
GATA1P15976 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
GATA1P15976 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
GATA1P15976 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
GATA1P15976 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GATA1P15976 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
GATA1P15976 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GATA1P15976 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
GATA1P15976 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
GATA1P15976 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
GATA1P15976 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
GATA1P15976 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
GATA1P15976 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
GATA1P15976 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
GATA1P15976 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
GATA1P15976 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
GATA1P15976 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GATA1P15976 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GATA1P15976 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GATA1P15976 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
GATA1P15976 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
GATA1P15976 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
GATA1P15976 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
GATA1P15976 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
GATA1P15976 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GATA1P15976 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GATA1P15976 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GATA1P15976 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GATA1P15976 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GATA1P15976 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GATA1P15976 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
GATA1P15976 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
GATA1P15976 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
GATA1P15976 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
GATA1P15976 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.6 ms