Protein–RNA interactions for Protein: P0DKX0

ZNF728, Zinc finger protein 728, humanhuman

Predictions only

Length 622 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF728P0DKX0 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZNF728P0DKX0 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZNF728P0DKX0 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZNF728P0DKX0 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ZNF728P0DKX0 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ZNF728P0DKX0 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ZNF728P0DKX0 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ZNF728P0DKX0 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ZNF728P0DKX0 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
ZNF728P0DKX0 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ZNF728P0DKX0 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ZNF728P0DKX0 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ZNF728P0DKX0 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ZNF728P0DKX0 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ZNF728P0DKX0 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
ZNF728P0DKX0 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
ZNF728P0DKX0 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ZNF728P0DKX0 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ZNF728P0DKX0 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ZNF728P0DKX0 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ZNF728P0DKX0 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ZNF728P0DKX0 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ZNF728P0DKX0 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZNF728P0DKX0 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZNF728P0DKX0 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZNF728P0DKX0 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZNF728P0DKX0 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZNF728P0DKX0 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZNF728P0DKX0 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZNF728P0DKX0 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZNF728P0DKX0 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZNF728P0DKX0 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ZNF728P0DKX0 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ZNF728P0DKX0 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ZNF728P0DKX0 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZNF728P0DKX0 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZNF728P0DKX0 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZNF728P0DKX0 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZNF728P0DKX0 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZNF728P0DKX0 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZNF728P0DKX0 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZNF728P0DKX0 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZNF728P0DKX0 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZNF728P0DKX0 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZNF728P0DKX0 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZNF728P0DKX0 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZNF728P0DKX0 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
ZNF728P0DKX0 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZNF728P0DKX0 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZNF728P0DKX0 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZNF728P0DKX0 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZNF728P0DKX0 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZNF728P0DKX0 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZNF728P0DKX0 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZNF728P0DKX0 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZNF728P0DKX0 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZNF728P0DKX0 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZNF728P0DKX0 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZNF728P0DKX0 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZNF728P0DKX0 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZNF728P0DKX0 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZNF728P0DKX0 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZNF728P0DKX0 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZNF728P0DKX0 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
ZNF728P0DKX0 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZNF728P0DKX0 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZNF728P0DKX0 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZNF728P0DKX0 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZNF728P0DKX0 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZNF728P0DKX0 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZNF728P0DKX0 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ZNF728P0DKX0 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZNF728P0DKX0 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZNF728P0DKX0 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZNF728P0DKX0 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZNF728P0DKX0 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZNF728P0DKX0 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZNF728P0DKX0 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZNF728P0DKX0 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZNF728P0DKX0 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZNF728P0DKX0 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZNF728P0DKX0 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZNF728P0DKX0 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZNF728P0DKX0 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZNF728P0DKX0 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZNF728P0DKX0 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ZNF728P0DKX0 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ZNF728P0DKX0 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZNF728P0DKX0 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZNF728P0DKX0 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZNF728P0DKX0 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZNF728P0DKX0 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZNF728P0DKX0 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
ZNF728P0DKX0 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZNF728P0DKX0 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZNF728P0DKX0 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZNF728P0DKX0 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZNF728P0DKX0 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
ZNF728P0DKX0 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZNF728P0DKX0 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.4 ms