Protein–RNA interactions for Protein: O75764

TCEA3, Transcription elongation factor A protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCEA3O75764 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
TCEA3O75764 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
TCEA3O75764 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
TCEA3O75764 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
TCEA3O75764 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
TCEA3O75764 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
TCEA3O75764 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
TCEA3O75764 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
TCEA3O75764 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
TCEA3O75764 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
TCEA3O75764 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
TCEA3O75764 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
TCEA3O75764 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
TCEA3O75764 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
TCEA3O75764 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
TCEA3O75764 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
TCEA3O75764 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
TCEA3O75764 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
TCEA3O75764 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
TCEA3O75764 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
TCEA3O75764 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
TCEA3O75764 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
TCEA3O75764 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
TCEA3O75764 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
TCEA3O75764 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
TCEA3O75764 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
TCEA3O75764 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
TCEA3O75764 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
TCEA3O75764 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
TCEA3O75764 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
TCEA3O75764 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
TCEA3O75764 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
TCEA3O75764 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
TCEA3O75764 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
TCEA3O75764 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
TCEA3O75764 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
TCEA3O75764 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
TCEA3O75764 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC27.75■■■□□ 2.03
TCEA3O75764 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
TCEA3O75764 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
TCEA3O75764 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
TCEA3O75764 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
TCEA3O75764 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
TCEA3O75764 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
TCEA3O75764 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
TCEA3O75764 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
TCEA3O75764 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
TCEA3O75764 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
TCEA3O75764 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
TCEA3O75764 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
TCEA3O75764 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
TCEA3O75764 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TCEA3O75764 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
TCEA3O75764 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TCEA3O75764 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
TCEA3O75764 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
TCEA3O75764 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
TCEA3O75764 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
TCEA3O75764 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
TCEA3O75764 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
TCEA3O75764 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
TCEA3O75764 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
TCEA3O75764 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
TCEA3O75764 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
TCEA3O75764 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TCEA3O75764 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TCEA3O75764 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TCEA3O75764 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TCEA3O75764 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
TCEA3O75764 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TCEA3O75764 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
TCEA3O75764 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TCEA3O75764 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TCEA3O75764 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
TCEA3O75764 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
TCEA3O75764 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
TCEA3O75764 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TCEA3O75764 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
TCEA3O75764 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
TCEA3O75764 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC27.52■■■□□ 2
TCEA3O75764 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
TCEA3O75764 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
TCEA3O75764 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
TCEA3O75764 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
TCEA3O75764 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
TCEA3O75764 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
TCEA3O75764 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
TCEA3O75764 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
TCEA3O75764 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
TCEA3O75764 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
TCEA3O75764 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
TCEA3O75764 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
TCEA3O75764 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
TCEA3O75764 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
TCEA3O75764 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TCEA3O75764 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TCEA3O75764 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
TCEA3O75764 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
TCEA3O75764 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
TCEA3O75764 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms