Protein–RNA interactions for Protein: O75575

CRCP, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC9, humanhuman

Predictions only

Length 148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRCPO75575 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CRCPO75575 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CRCPO75575 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CRCPO75575 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CRCPO75575 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CRCPO75575 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CRCPO75575 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CRCPO75575 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CRCPO75575 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CRCPO75575 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CRCPO75575 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CRCPO75575 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
CRCPO75575 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CRCPO75575 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CRCPO75575 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CRCPO75575 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CRCPO75575 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CRCPO75575 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CRCPO75575 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CRCPO75575 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CRCPO75575 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CRCPO75575 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CRCPO75575 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
CRCPO75575 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CRCPO75575 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CRCPO75575 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CRCPO75575 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CRCPO75575 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CRCPO75575 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CRCPO75575 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CRCPO75575 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CRCPO75575 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
CRCPO75575 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CRCPO75575 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CRCPO75575 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CRCPO75575 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CRCPO75575 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CRCPO75575 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CRCPO75575 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CRCPO75575 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CRCPO75575 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CRCPO75575 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CRCPO75575 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CRCPO75575 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CRCPO75575 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CRCPO75575 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CRCPO75575 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CRCPO75575 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CRCPO75575 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CRCPO75575 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CRCPO75575 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CRCPO75575 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CRCPO75575 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CRCPO75575 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CRCPO75575 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CRCPO75575 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CRCPO75575 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CRCPO75575 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CRCPO75575 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CRCPO75575 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CRCPO75575 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CRCPO75575 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
CRCPO75575 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CRCPO75575 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CRCPO75575 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CRCPO75575 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CRCPO75575 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CRCPO75575 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
CRCPO75575 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CRCPO75575 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
CRCPO75575 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CRCPO75575 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CRCPO75575 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CRCPO75575 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CRCPO75575 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CRCPO75575 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CRCPO75575 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CRCPO75575 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CRCPO75575 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CRCPO75575 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CRCPO75575 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CRCPO75575 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CRCPO75575 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CRCPO75575 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CRCPO75575 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CRCPO75575 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CRCPO75575 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CRCPO75575 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CRCPO75575 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CRCPO75575 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CRCPO75575 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CRCPO75575 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CRCPO75575 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CRCPO75575 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CRCPO75575 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CRCPO75575 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CRCPO75575 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CRCPO75575 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CRCPO75575 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CRCPO75575 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.6 ms