Protein–RNA interactions for Protein: O43272

PRODH, Proline dehydrogenase 1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 600 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRODHO43272 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PRODHO43272 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PRODHO43272 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PRODHO43272 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PRODHO43272 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PRODHO43272 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PRODHO43272 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PRODHO43272 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PRODHO43272 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PRODHO43272 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PRODHO43272 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PRODHO43272 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PRODHO43272 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PRODHO43272 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PRODHO43272 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PRODHO43272 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
PRODHO43272 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PRODHO43272 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PRODHO43272 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PRODHO43272 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PRODHO43272 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PRODHO43272 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PRODHO43272 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PRODHO43272 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PRODHO43272 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PRODHO43272 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PRODHO43272 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
PRODHO43272 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
PRODHO43272 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PRODHO43272 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PRODHO43272 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PRODHO43272 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PRODHO43272 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PRODHO43272 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PRODHO43272 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PRODHO43272 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PRODHO43272 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PRODHO43272 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PRODHO43272 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
PRODHO43272 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PRODHO43272 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PRODHO43272 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PRODHO43272 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PRODHO43272 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
PRODHO43272 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PRODHO43272 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PRODHO43272 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PRODHO43272 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PRODHO43272 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PRODHO43272 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PRODHO43272 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PRODHO43272 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PRODHO43272 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PRODHO43272 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PRODHO43272 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PRODHO43272 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PRODHO43272 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PRODHO43272 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PRODHO43272 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PRODHO43272 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PRODHO43272 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PRODHO43272 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PRODHO43272 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PRODHO43272 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
PRODHO43272 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PRODHO43272 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PRODHO43272 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PRODHO43272 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PRODHO43272 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PRODHO43272 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
PRODHO43272 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PRODHO43272 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PRODHO43272 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PRODHO43272 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PRODHO43272 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PRODHO43272 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRODHO43272 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
PRODHO43272 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
PRODHO43272 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PRODHO43272 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PRODHO43272 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRODHO43272 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRODHO43272 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PRODHO43272 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
PRODHO43272 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PRODHO43272 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PRODHO43272 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PRODHO43272 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PRODHO43272 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PRODHO43272 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PRODHO43272 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PRODHO43272 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PRODHO43272 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PRODHO43272 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PRODHO43272 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PRODHO43272 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PRODHO43272 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PRODHO43272 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PRODHO43272 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PRODHO43272 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98.8 ms