Protein–RNA interactions for Protein: O43169

CYB5B, Cytochrome b5 type B, humanhuman

Predictions only

Length 146 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYB5BO43169 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CYB5BO43169 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CYB5BO43169 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CYB5BO43169 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CYB5BO43169 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CYB5BO43169 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CYB5BO43169 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CYB5BO43169 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CYB5BO43169 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CYB5BO43169 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CYB5BO43169 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CYB5BO43169 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
CYB5BO43169 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CYB5BO43169 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CYB5BO43169 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CYB5BO43169 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CYB5BO43169 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CYB5BO43169 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CYB5BO43169 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CYB5BO43169 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CYB5BO43169 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CYB5BO43169 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CYB5BO43169 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CYB5BO43169 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
CYB5BO43169 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CYB5BO43169 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CYB5BO43169 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
CYB5BO43169 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CYB5BO43169 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CYB5BO43169 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CYB5BO43169 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CYB5BO43169 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CYB5BO43169 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CYB5BO43169 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CYB5BO43169 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
CYB5BO43169 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CYB5BO43169 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CYB5BO43169 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CYB5BO43169 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CYB5BO43169 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CYB5BO43169 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CYB5BO43169 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CYB5BO43169 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CYB5BO43169 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CYB5BO43169 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
CYB5BO43169 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CYB5BO43169 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CYB5BO43169 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CYB5BO43169 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CYB5BO43169 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CYB5BO43169 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CYB5BO43169 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CYB5BO43169 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CYB5BO43169 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CYB5BO43169 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CYB5BO43169 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CYB5BO43169 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CYB5BO43169 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CYB5BO43169 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CYB5BO43169 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CYB5BO43169 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CYB5BO43169 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CYB5BO43169 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CYB5BO43169 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CYB5BO43169 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CYB5BO43169 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CYB5BO43169 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CYB5BO43169 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CYB5BO43169 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
CYB5BO43169 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CYB5BO43169 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
CYB5BO43169 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CYB5BO43169 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CYB5BO43169 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CYB5BO43169 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CYB5BO43169 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CYB5BO43169 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CYB5BO43169 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CYB5BO43169 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CYB5BO43169 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CYB5BO43169 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CYB5BO43169 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CYB5BO43169 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CYB5BO43169 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CYB5BO43169 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CYB5BO43169 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CYB5BO43169 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CYB5BO43169 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CYB5BO43169 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CYB5BO43169 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CYB5BO43169 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CYB5BO43169 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CYB5BO43169 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CYB5BO43169 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CYB5BO43169 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CYB5BO43169 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CYB5BO43169 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CYB5BO43169 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CYB5BO43169 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CYB5BO43169 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.6 ms