Protein–RNA interactions for Protein: O00193

SMAP, Small acidic protein, humanhuman

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Length 183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAPO00193 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SMAPO00193 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SMAPO00193 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SMAPO00193 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SMAPO00193 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SMAPO00193 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SMAPO00193 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SMAPO00193 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
SMAPO00193 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SMAPO00193 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
SMAPO00193 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
SMAPO00193 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SMAPO00193 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SMAPO00193 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SMAPO00193 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SMAPO00193 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SMAPO00193 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SMAPO00193 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SMAPO00193 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SMAPO00193 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
SMAPO00193 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SMAPO00193 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SMAPO00193 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SMAPO00193 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
SMAPO00193 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
SMAPO00193 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SMAPO00193 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC27.56■■■□□ 2
SMAPO00193 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SMAPO00193 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
SMAPO00193 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SMAPO00193 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SMAPO00193 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC27.55■■■□□ 2
SMAPO00193 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SMAPO00193 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SMAPO00193 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SMAPO00193 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
SMAPO00193 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
SMAPO00193 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SMAPO00193 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SMAPO00193 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SMAPO00193 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
SMAPO00193 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
SMAPO00193 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SMAPO00193 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SMAPO00193 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SMAPO00193 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SMAPO00193 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SMAPO00193 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SMAPO00193 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SMAPO00193 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
SMAPO00193 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
SMAPO00193 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SMAPO00193 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SMAPO00193 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SMAPO00193 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SMAPO00193 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
SMAPO00193 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
SMAPO00193 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SMAPO00193 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SMAPO00193 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SMAPO00193 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SMAPO00193 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SMAPO00193 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SMAPO00193 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SMAPO00193 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
SMAPO00193 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SMAPO00193 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SMAPO00193 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SMAPO00193 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SMAPO00193 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SMAPO00193 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SMAPO00193 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SMAPO00193 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SMAPO00193 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SMAPO00193 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SMAPO00193 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SMAPO00193 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SMAPO00193 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SMAPO00193 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SMAPO00193 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SMAPO00193 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SMAPO00193 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SMAPO00193 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SMAPO00193 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SMAPO00193 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SMAPO00193 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SMAPO00193 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SMAPO00193 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SMAPO00193 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SMAPO00193 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SMAPO00193 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SMAPO00193 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SMAPO00193 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SMAPO00193 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SMAPO00193 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SMAPO00193 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SMAPO00193 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SMAPO00193 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
SMAPO00193 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SMAPO00193 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
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