Protein–RNA interactions for Protein: F8W8V4

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F8W8V4 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
F8W8V4 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
F8W8V4 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
F8W8V4 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
F8W8V4 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
F8W8V4 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
F8W8V4 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
F8W8V4 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
F8W8V4 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
F8W8V4 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
F8W8V4 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
F8W8V4 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
F8W8V4 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
F8W8V4 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
F8W8V4 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
F8W8V4 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
F8W8V4 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
F8W8V4 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
F8W8V4 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
F8W8V4 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
F8W8V4 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
F8W8V4 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
F8W8V4 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
F8W8V4 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
F8W8V4 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
F8W8V4 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
F8W8V4 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
F8W8V4 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
F8W8V4 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
F8W8V4 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
F8W8V4 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
F8W8V4 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
F8W8V4 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC27.05■■□□□ 1.92
F8W8V4 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
F8W8V4 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
F8W8V4 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
F8W8V4 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
F8W8V4 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
F8W8V4 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
F8W8V4 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
F8W8V4 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
F8W8V4 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
F8W8V4 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
F8W8V4 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
F8W8V4 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
F8W8V4 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
F8W8V4 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
F8W8V4 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
F8W8V4 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
F8W8V4 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
F8W8V4 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
F8W8V4 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
F8W8V4 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
F8W8V4 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
F8W8V4 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
F8W8V4 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
F8W8V4 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
F8W8V4 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
F8W8V4 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
F8W8V4 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
F8W8V4 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
F8W8V4 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
F8W8V4 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
F8W8V4 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
F8W8V4 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
F8W8V4 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
F8W8V4 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
F8W8V4 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
F8W8V4 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
F8W8V4 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
F8W8V4 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
F8W8V4 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
F8W8V4 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
F8W8V4 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.88
F8W8V4 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
F8W8V4 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
F8W8V4 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
F8W8V4 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
F8W8V4 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
F8W8V4 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
F8W8V4 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
F8W8V4 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
F8W8V4 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
F8W8V4 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
F8W8V4 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
F8W8V4 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
F8W8V4 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
F8W8V4 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
F8W8V4 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
F8W8V4 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
F8W8V4 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
F8W8V4 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
F8W8V4 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
F8W8V4 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
F8W8V4 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
F8W8V4 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
F8W8V4 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
F8W8V4 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
F8W8V4 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
F8W8V4 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms