Protein–RNA interactions for Protein: F8VVB4

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F8VVB4 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
F8VVB4 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
F8VVB4 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
F8VVB4 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
F8VVB4 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
F8VVB4 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
F8VVB4 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
F8VVB4 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
F8VVB4 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
F8VVB4 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
F8VVB4 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
F8VVB4 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
F8VVB4 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
F8VVB4 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
F8VVB4 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
F8VVB4 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
F8VVB4 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
F8VVB4 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
F8VVB4 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
F8VVB4 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
F8VVB4 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
F8VVB4 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
F8VVB4 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
F8VVB4 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
F8VVB4 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
F8VVB4 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
F8VVB4 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
F8VVB4 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
F8VVB4 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
F8VVB4 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
F8VVB4 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
F8VVB4 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
F8VVB4 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
F8VVB4 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
F8VVB4 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
F8VVB4 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
F8VVB4 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
F8VVB4 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
F8VVB4 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
F8VVB4 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
F8VVB4 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
F8VVB4 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
F8VVB4 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
F8VVB4 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
F8VVB4 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
F8VVB4 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
F8VVB4 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
F8VVB4 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
F8VVB4 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
F8VVB4 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
F8VVB4 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
F8VVB4 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
F8VVB4 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
F8VVB4 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
F8VVB4 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
F8VVB4 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
F8VVB4 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
F8VVB4 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
F8VVB4 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
F8VVB4 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
F8VVB4 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
F8VVB4 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
F8VVB4 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
F8VVB4 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
F8VVB4 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
F8VVB4 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
F8VVB4 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
F8VVB4 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
F8VVB4 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
F8VVB4 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
F8VVB4 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
F8VVB4 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
F8VVB4 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
F8VVB4 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
F8VVB4 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
F8VVB4 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
F8VVB4 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
F8VVB4 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
F8VVB4 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
F8VVB4 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
F8VVB4 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
F8VVB4 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
F8VVB4 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
F8VVB4 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
F8VVB4 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
F8VVB4 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
F8VVB4 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
F8VVB4 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
F8VVB4 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
F8VVB4 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
F8VVB4 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
F8VVB4 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
F8VVB4 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
F8VVB4 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
F8VVB4 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
F8VVB4 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
F8VVB4 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
F8VVB4 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
F8VVB4 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
F8VVB4 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms