Protein–RNA interactions for Protein: C9JSJ3

BHMG1, Basic helix-loop-helix and HMG box domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHMG1C9JSJ3 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.12
BHMG1C9JSJ3 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
BHMG1C9JSJ3 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
BHMG1C9JSJ3 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
BHMG1C9JSJ3 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
BHMG1C9JSJ3 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
BHMG1C9JSJ3 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
BHMG1C9JSJ3 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
BHMG1C9JSJ3 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
BHMG1C9JSJ3 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
BHMG1C9JSJ3 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
BHMG1C9JSJ3 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC28.19■■■□□ 2.1
BHMG1C9JSJ3 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
BHMG1C9JSJ3 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
BHMG1C9JSJ3 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
BHMG1C9JSJ3 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
BHMG1C9JSJ3 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC28.18■■■□□ 2.1
BHMG1C9JSJ3 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
BHMG1C9JSJ3 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
BHMG1C9JSJ3 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
BHMG1C9JSJ3 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
BHMG1C9JSJ3 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
BHMG1C9JSJ3 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
BHMG1C9JSJ3 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
BHMG1C9JSJ3 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
BHMG1C9JSJ3 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
BHMG1C9JSJ3 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
BHMG1C9JSJ3 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
BHMG1C9JSJ3 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
BHMG1C9JSJ3 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
BHMG1C9JSJ3 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
BHMG1C9JSJ3 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
BHMG1C9JSJ3 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
BHMG1C9JSJ3 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
BHMG1C9JSJ3 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
BHMG1C9JSJ3 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
BHMG1C9JSJ3 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
BHMG1C9JSJ3 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
BHMG1C9JSJ3 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
BHMG1C9JSJ3 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
BHMG1C9JSJ3 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
BHMG1C9JSJ3 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
BHMG1C9JSJ3 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
BHMG1C9JSJ3 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
BHMG1C9JSJ3 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
BHMG1C9JSJ3 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
BHMG1C9JSJ3 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
BHMG1C9JSJ3 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
BHMG1C9JSJ3 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
BHMG1C9JSJ3 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
BHMG1C9JSJ3 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
BHMG1C9JSJ3 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
BHMG1C9JSJ3 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
BHMG1C9JSJ3 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
BHMG1C9JSJ3 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
BHMG1C9JSJ3 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
BHMG1C9JSJ3 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
BHMG1C9JSJ3 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
BHMG1C9JSJ3 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
BHMG1C9JSJ3 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
BHMG1C9JSJ3 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
BHMG1C9JSJ3 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
BHMG1C9JSJ3 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
BHMG1C9JSJ3 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
BHMG1C9JSJ3 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
BHMG1C9JSJ3 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
BHMG1C9JSJ3 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
BHMG1C9JSJ3 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
BHMG1C9JSJ3 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
BHMG1C9JSJ3 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
BHMG1C9JSJ3 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
BHMG1C9JSJ3 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
BHMG1C9JSJ3 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
BHMG1C9JSJ3 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
BHMG1C9JSJ3 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
BHMG1C9JSJ3 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
BHMG1C9JSJ3 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
BHMG1C9JSJ3 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
BHMG1C9JSJ3 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
BHMG1C9JSJ3 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
BHMG1C9JSJ3 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
BHMG1C9JSJ3 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
BHMG1C9JSJ3 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
BHMG1C9JSJ3 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
BHMG1C9JSJ3 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
BHMG1C9JSJ3 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
BHMG1C9JSJ3 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC27.81■■■□□ 2.04
BHMG1C9JSJ3 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
BHMG1C9JSJ3 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
BHMG1C9JSJ3 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
BHMG1C9JSJ3 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC27.76■■■□□ 2.03
BHMG1C9JSJ3 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
BHMG1C9JSJ3 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
BHMG1C9JSJ3 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
BHMG1C9JSJ3 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
BHMG1C9JSJ3 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
BHMG1C9JSJ3 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
BHMG1C9JSJ3 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
BHMG1C9JSJ3 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
BHMG1C9JSJ3 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.4 ms