Protein–RNA interactions for Protein: B4DU55

ZNF879, Zinc finger protein 879, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF879B4DU55 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ZNF879B4DU55 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ZNF879B4DU55 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ZNF879B4DU55 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ZNF879B4DU55 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ZNF879B4DU55 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ZNF879B4DU55 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ZNF879B4DU55 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ZNF879B4DU55 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ZNF879B4DU55 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ZNF879B4DU55 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ZNF879B4DU55 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ZNF879B4DU55 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ZNF879B4DU55 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ZNF879B4DU55 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ZNF879B4DU55 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ZNF879B4DU55 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ZNF879B4DU55 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
ZNF879B4DU55 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
ZNF879B4DU55 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ZNF879B4DU55 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ZNF879B4DU55 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ZNF879B4DU55 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ZNF879B4DU55 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ZNF879B4DU55 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ZNF879B4DU55 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ZNF879B4DU55 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ZNF879B4DU55 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ZNF879B4DU55 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ZNF879B4DU55 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ZNF879B4DU55 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ZNF879B4DU55 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
ZNF879B4DU55 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ZNF879B4DU55 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ZNF879B4DU55 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ZNF879B4DU55 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ZNF879B4DU55 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ZNF879B4DU55 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ZNF879B4DU55 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ZNF879B4DU55 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ZNF879B4DU55 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ZNF879B4DU55 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ZNF879B4DU55 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ZNF879B4DU55 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ZNF879B4DU55 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ZNF879B4DU55 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
ZNF879B4DU55 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ZNF879B4DU55 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ZNF879B4DU55 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ZNF879B4DU55 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ZNF879B4DU55 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ZNF879B4DU55 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ZNF879B4DU55 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ZNF879B4DU55 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ZNF879B4DU55 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ZNF879B4DU55 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ZNF879B4DU55 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ZNF879B4DU55 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ZNF879B4DU55 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ZNF879B4DU55 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
ZNF879B4DU55 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ZNF879B4DU55 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ZNF879B4DU55 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ZNF879B4DU55 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ZNF879B4DU55 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ZNF879B4DU55 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ZNF879B4DU55 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ZNF879B4DU55 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ZNF879B4DU55 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ZNF879B4DU55 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ZNF879B4DU55 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ZNF879B4DU55 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ZNF879B4DU55 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ZNF879B4DU55 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ZNF879B4DU55 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ZNF879B4DU55 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ZNF879B4DU55 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ZNF879B4DU55 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ZNF879B4DU55 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ZNF879B4DU55 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ZNF879B4DU55 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
ZNF879B4DU55 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ZNF879B4DU55 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ZNF879B4DU55 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ZNF879B4DU55 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ZNF879B4DU55 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ZNF879B4DU55 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZNF879B4DU55 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
ZNF879B4DU55 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ZNF879B4DU55 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ZNF879B4DU55 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ZNF879B4DU55 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ZNF879B4DU55 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ZNF879B4DU55 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ZNF879B4DU55 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ZNF879B4DU55 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ZNF879B4DU55 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ZNF879B4DU55 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ZNF879B4DU55 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ZNF879B4DU55 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.6 ms