Protein–RNA interactions for Protein: A6NIN4

Putative uncharacterized protein FLJ38447, humanhuman

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A6NIN4 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
A6NIN4 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
A6NIN4 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
A6NIN4 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
A6NIN4 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
A6NIN4 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
A6NIN4 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
A6NIN4 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
A6NIN4 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
A6NIN4 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
A6NIN4 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
A6NIN4 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
A6NIN4 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
A6NIN4 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
A6NIN4 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
A6NIN4 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
A6NIN4 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
A6NIN4 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
A6NIN4 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
A6NIN4 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
A6NIN4 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
A6NIN4 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
A6NIN4 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
A6NIN4 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
A6NIN4 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
A6NIN4 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
A6NIN4 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
A6NIN4 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
A6NIN4 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
A6NIN4 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
A6NIN4 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
A6NIN4 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
A6NIN4 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
A6NIN4 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
A6NIN4 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
A6NIN4 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
A6NIN4 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
A6NIN4 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
A6NIN4 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
A6NIN4 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
A6NIN4 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
A6NIN4 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
A6NIN4 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
A6NIN4 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
A6NIN4 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
A6NIN4 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
A6NIN4 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
A6NIN4 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
A6NIN4 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
A6NIN4 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
A6NIN4 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
A6NIN4 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
A6NIN4 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
A6NIN4 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
A6NIN4 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
A6NIN4 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
A6NIN4 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
A6NIN4 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
A6NIN4 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
A6NIN4 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
A6NIN4 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
A6NIN4 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
A6NIN4 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
A6NIN4 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
A6NIN4 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
A6NIN4 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
A6NIN4 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
A6NIN4 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
A6NIN4 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
A6NIN4 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
A6NIN4 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
A6NIN4 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
A6NIN4 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
A6NIN4 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
A6NIN4 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
A6NIN4 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
A6NIN4 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
A6NIN4 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
A6NIN4 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
A6NIN4 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
A6NIN4 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
A6NIN4 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
A6NIN4 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
A6NIN4 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
A6NIN4 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
A6NIN4 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
A6NIN4 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
A6NIN4 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
A6NIN4 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
A6NIN4 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
A6NIN4 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
A6NIN4 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
A6NIN4 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
A6NIN4 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
A6NIN4 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
A6NIN4 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
A6NIN4 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
A6NIN4 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
A6NIN4 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
A6NIN4 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.9 ms